More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2221 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2221  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
562 aa  1105    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.202713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2082  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  88.41 
 
 
562 aa  936    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.126939  normal  0.0929922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  68.77 
 
 
568 aa  741    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.3 
 
 
583 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17930  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  59.29 
 
 
574 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.849454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  60.8 
 
 
569 aa  613  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1327  AMP-dependent synthetase and ligase  55.28 
 
 
571 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1973  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 
553 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 
584 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 
569 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  43.48 
 
 
566 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
563 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
563 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
582 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 
561 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.38 
 
 
563 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.56 
 
 
563 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 
582 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.53 
 
 
561 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 
561 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 
565 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 
561 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  43.61 
 
 
549 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.15 
 
 
561 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  46.8 
 
 
551 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
551 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  44.04 
 
 
558 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
591 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 
557 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 
539 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  40.9 
 
 
561 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
590 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 
583 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 
585 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
564 aa  395  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
584 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 
573 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 
559 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
577 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
583 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
559 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  39.18 
 
 
561 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 
560 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
559 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 
554 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  40 
 
 
565 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
562 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
575 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
561 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
561 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 
573 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
561 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  39.34 
 
 
560 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  41.71 
 
 
566 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 
561 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
583 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
583 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 
561 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
566 aa  372  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
564 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
561 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
557 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.18 
 
 
561 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
559 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 
557 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.59 
 
 
572 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 
584 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  40.36 
 
 
569 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  39.68 
 
 
599 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
585 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  39.43 
 
 
604 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.49 
 
 
557 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3653  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
578 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
578 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0770506  normal  0.73273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 
577 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 
557 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 
562 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 
562 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.81 
 
 
557 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
567 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.97 
 
 
563 aa  365  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
569 aa  364  2e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  35.96 
 
 
569 aa  364  3e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 
557 aa  364  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
557 aa  364  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
557 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.63 
 
 
557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 
601 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
557 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
559 aa  362  8e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 
569 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 
572 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.68 
 
 
561 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>