More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0242 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  100 
 
 
264 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  67.5 
 
 
281 aa  342  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  56.43 
 
 
276 aa  265  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  48.64 
 
 
270 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  52.92 
 
 
262 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  45.83 
 
 
264 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  47.97 
 
 
277 aa  229  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  34.41 
 
 
277 aa  145  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35.2 
 
 
268 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  35.96 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  36.22 
 
 
324 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  33.64 
 
 
309 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  29.67 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  28.96 
 
 
351 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.91 
 
 
356 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  27.2 
 
 
298 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  30.04 
 
 
288 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  28.95 
 
 
897 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  32.38 
 
 
781 aa  95.9  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
205 aa  95.9  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  31.1 
 
 
948 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.38 
 
 
920 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.19 
 
 
431 aa  92.4  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  30.84 
 
 
869 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  30.12 
 
 
992 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
936 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  34.11 
 
 
417 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.47 
 
 
362 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.52 
 
 
374 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  36.76 
 
 
184 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
869 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  31.28 
 
 
417 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  32.14 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.32 
 
 
473 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.58 
 
 
373 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  31.6 
 
 
379 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  31.73 
 
 
952 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  29.13 
 
 
333 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  29.84 
 
 
992 aa  84.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  30.66 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  26.02 
 
 
920 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.3 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  33.68 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  27.85 
 
 
869 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  28.42 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  33.68 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  25.09 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
495 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  30.72 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.62 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  33.16 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.67 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  28.36 
 
 
386 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  28.37 
 
 
823 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  24.78 
 
 
919 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  33.13 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
833 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  23.76 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  32.46 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  32.53 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.32 
 
 
910 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  26.52 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  34.45 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  28.57 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  33.97 
 
 
834 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  29.96 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  34.52 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  26.57 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.7 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.51 
 
 
508 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  30.72 
 
 
270 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.06 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25 
 
 
931 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.82 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  30.81 
 
 
779 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  26.26 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  28.15 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.35 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  35.8 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  25.98 
 
 
379 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  28.09 
 
 
753 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  31.87 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  30.94 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  35.46 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  26.91 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.49 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  34.68 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.75 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.88 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  27.8 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.88 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.88 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.88 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>