103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0460 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0460  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  100 
 
 
387 aa  778    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2516  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  67.7 
 
 
370 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1933  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  51.63 
 
 
388 aa  344  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0388  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  49.23 
 
 
388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1940  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  45.52 
 
 
383 aa  299  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2697  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  50.88 
 
 
431 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3809  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  37.93 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0008  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.08 
 
 
325 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000406397  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04160  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.88 
 
 
367 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0455  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  31.38 
 
 
360 aa  124  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.617088  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0885  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  33.19 
 
 
361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.420494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1200  ABC transporter periplasmic-binding protein  31.29 
 
 
334 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00816728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0314  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.11 
 
 
363 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000495948  hitchhiker  0.00896596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0746  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32.74 
 
 
344 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31210  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  30.52 
 
 
357 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3107  thiamine transporter substrate binding subunit  27.69 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0261  ABC transporter periplasmic-binding protein  29 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4266  thiamine transporter substrate binding subunit  25.99 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0218  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  32 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.195863  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3259  thiamine transporter substrate binding subunit  29.75 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288476  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1142  thiamine transporter substrate binding subunit  26.71 
 
 
334 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.493947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0433  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.31 
 
 
359 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127437  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0178  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  33.33 
 
 
386 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3056  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.78 
 
 
353 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.450675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00070  thiamin transporter subunit  26.75 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3531  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.75 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00069  hypothetical protein  26.75 
 
 
327 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0070  thiamine transporter substrate binding subunit  26.75 
 
 
327 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0072  thiamine transporter substrate binding subunit  26.75 
 
 
327 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3589  thiamine transporter substrate binding subunit  26.75 
 
 
327 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000386995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  29.44 
 
 
325 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2943  thiamine transporter substrate binding subunit  25.85 
 
 
348 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.683707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0072  thiamine transporter substrate binding subunit  26.44 
 
 
327 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0060  thiamine transporter substrate binding subunit  26.75 
 
 
327 aa  99.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0073  thiamine transporter substrate binding subunit  26.75 
 
 
327 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2119  thiamine transporter substrate binding subunit  28 
 
 
330 aa  97.8  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0119  thiamine transporter substrate binding subunit  25.98 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0289441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0115  thiamine transporter substrate binding subunit  26.14 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0114  thiamine transporter substrate binding subunit  26.14 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  0.157223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0112  thiamine transporter substrate binding subunit  26.14 
 
 
327 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0615  thiamine transporter substrate binding subunit  25.85 
 
 
327 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0282494 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3542  thiamine transporter substrate binding subunit  25.85 
 
 
358 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1757  thiamine transporter substrate binding subunit  26.01 
 
 
334 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0119  thiamine transporter substrate binding subunit  26.14 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0584  thiamine transporter substrate binding subunit  26.91 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00788  thiamine transporter substrate binding subunit  25.99 
 
 
330 aa  96.3  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0623  thiamine transporter substrate binding subunit  27.81 
 
 
327 aa  96.3  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001686  thiamin ABC transporter substrate-binding component  25.69 
 
 
330 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.62 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3808  thiamine transporter substrate binding subunit  28.06 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3619  thiamine transporter substrate binding subunit  28.06 
 
 
338 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1933  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.7 
 
 
343 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.567061  normal  0.262856 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0349  thiamine transporter substrate binding subunit  26.32 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1695  thiamine transporter substrate binding subunit  25.47 
 
 
334 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.724988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0737  thiamine transporter substrate binding subunit  25.54 
 
 
328 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0385  thiamine transporter substrate binding subunit  26.22 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0796265  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04580  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  28.51 
 
 
392 aa  90.5  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0330  thiamine transporter substrate binding subunit  29.75 
 
 
335 aa  89.7  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0143  thiamine ABC transporter, thiamine-binding protein  24.83 
 
 
336 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19460  ABC transporter periplasmic binding protein, thiB subfamily  29.76 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.39 
 
 
325 aa  87.4  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1013  thiamine ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.95 
 
 
338 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0137605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3246  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.51 
 
 
340 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.791239  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2818  thiamine transporter substrate binding subunit  29.64 
 
 
326 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458711  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3336  ABC transporter, periplasmic binding protein, thiB subfamily  26.58 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.419962  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0058  thiamine transporter substrate binding subunit  29.59 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1391  thiamine transporter substrate binding subunit  29.59 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.994265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2798  thiamine transporter substrate binding subunit  29.59 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1958  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.54 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0213047  hitchhiker  1.86869e-16 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0214  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.75 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1089  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.54 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.167186  normal  0.0159055 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2140  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.32 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3813  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941713  hitchhiker  0.00422068 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0223  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  22.67 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0223  hypothetical protein  22.67 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
339 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3234  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
345 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0952869  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1477  ABC transporter, substrate-binding protein  22.53 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0040976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
345 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
347 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0051  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
378 aa  50.4  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115612  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0386  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.92 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000551212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0855  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.03 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1900  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.03 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1758  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  27.03 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0220155  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2212  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  27.03 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0584  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  27.03 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0487  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  27.03 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0896  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, periplasmic 2-aminoethylphosphonate-binding protein  27.03 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.26 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.909966  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0970  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000273849  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2054  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.14 
 
 
360 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5374  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.59 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0583866  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.59 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4569  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0818  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.13 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4785  extracellular solute-binding protein  20.59 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.13 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34313  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1786  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.13 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.13 
 
 
356 aa  43.1  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0448  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.13 
 
 
362 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>