220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3614 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3025  glycoside hydrolase 15-related  94.64 
 
 		 597 aa  1171    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3614  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 597 aa  1223    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.633662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0235  glycoside hydrolase 15-related  51.6 
 
 		 599 aa  612  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794837  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0006  glycoside hydrolase 15-related  51.83 
 
 		 595 aa  595  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1121  glycoside hydrolase 15-related  52.28 
 
 		 595 aa  591  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3132  glycoside hydrolase 15-related  47.74 
 
 		 598 aa  587  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1816  glycoside hydrolase 15-related  49.41 
 
 		 596 aa  585  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1528  glycoside hydrolase 15-related  48.56 
 
 		 593 aa  568  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0307  glycoside hydrolase 15-related  49.17 
 
 		 603 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3154  glycoside hydrolase 15-related  50.25 
 
 		 593 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0356  glycoside hydrolase 15-related  48.9 
 
 		 620 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0415  glycoside hydrolase 15-like protein  48.64 
 
 		 624 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1778  glycoside hydrolase 15-related  48.06 
 
 		 598 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743693  normal  0.0628922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0986  glycoside hydrolase 15-related  48.57 
 
 		 640 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0518  glycoside hydrolase 15-related  47.72 
 
 		 606 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4211  glycoside hydrolase 15-related protein  47.02 
 
 		 657 aa  545  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  normal  0.475845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0525  glycoside hydrolase 15-related  48.21 
 
 		 606 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0502  glycoside hydrolase 15-related  47.72 
 
 		 606 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.830994  normal  0.0194391 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04868  glycosyl hydrolase, family 15  48.99 
 
 		 592 aa  547  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3609  glycoside hydrolase 15-related  47.55 
 
 		 598 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1018  glycoside hydrolase 15-related  48.38 
 
 		 589 aa  538  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0623694  normal  0.517609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1504  glycoside hydrolase 15-related  46.85 
 
 		 594 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3791  hypothetical protein  47.46 
 
 		 598 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000380463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3916  glycoside hydrolase 15-related  46.53 
 
 		 618 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.267662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4023  glycoside hydrolase 15-related  37.41 
 
 		 593 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000792533  normal  0.121588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0399  glucoamylase-related protein, trehalase  36.95 
 
 		 593 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216447  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  36.86 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  35.31 
 
 		 586 aa  309  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  34.49 
 
 		 605 aa  302  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  33.11 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  34.23 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  34.05 
 
 		 611 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 		 609 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  34.06 
 
 		 609 aa  296  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  35.15 
 
 		 598 aa  296  9e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  33.39 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  35.51 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 609 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  33.89 
 
 		 609 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  33.61 
 
 		 609 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  32.78 
 
 		 601 aa  293  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  33.55 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 623 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  32.62 
 
 		 602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  33.89 
 
 		 602 aa  287  5e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  33.94 
 
 		 617 aa  286  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  33.88 
 
 		 597 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  33.06 
 
 		 623 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  33.87 
 
 		 629 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  32.58 
 
 		 619 aa  281  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  32.44 
 
 		 599 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  34.78 
 
 		 602 aa  280  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  34.61 
 
 		 602 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4692  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 627 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.761206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  33.33 
 
 		 628 aa  276  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  33.28 
 
 		 626 aa  276  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  33.5 
 
 		 614 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  32.67 
 
 		 610 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  33.83 
 
 		 600 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  33.55 
 
 		 626 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  33.72 
 
 		 611 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4323  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 		 627 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.322378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  32.95 
 
 		 619 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  30.67 
 
 		 612 aa  273  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  34.78 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  32.56 
 
 		 665 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  32.78 
 
 		 619 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  32.89 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  32.84 
 
 		 620 aa  270  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  32.78 
 
 		 601 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2475  glycoside hydrolase 15-related  32.15 
 
 		 621 aa  270  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  32.61 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  33.44 
 
 		 627 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  32.5 
 
 		 616 aa  267  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  31.87 
 
 		 598 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4840  glycoside hydrolase 15-related  32.62 
 
 		 635 aa  266  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0898211  normal  0.818713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  30.59 
 
 		 627 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  31.84 
 
 		 594 aa  264  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  32.46 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  31.86 
 
 		 600 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  32.83 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  30.74 
 
 		 612 aa  261  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  32.34 
 
 		 613 aa  260  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  32.51 
 
 		 850 aa  260  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  30.97 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  31.22 
 
 		 608 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  31.89 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  33.22 
 
 		 599 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  30.67 
 
 		 598 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  31.03 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  32.01 
 
 		 602 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  31.55 
 
 		 596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  31.97 
 
 		 645 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3972  glycoside hydrolase 15-related  31.13 
 
 		 594 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>