288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4422 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
71 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  72.31 
 
 
69 aa  91.3  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
68 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  64.62 
 
 
69 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  63.08 
 
 
70 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  59.38 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  56.52 
 
 
68 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  61.54 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 
76 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  61.9 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  70.15 
 
 
69 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  50.77 
 
 
68 aa  73.6  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  55.71 
 
 
73 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  60.32 
 
 
70 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  52.31 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  57.38 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  54.69 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  55.56 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  55.71 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  55.74 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  56.45 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  56.25 
 
 
75 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  56.72 
 
 
109 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  55.22 
 
 
71 aa  65.5  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  55.93 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  50.82 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  64.18 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  55.22 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 
70 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
76 aa  62.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  50.82 
 
 
70 aa  62.8  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  54.24 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 
70 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 
70 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 
839 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  49.15 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  52.38 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3544  Heavy metal transport/detoxification protein  53.45 
 
 
70 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.480212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  45.07 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  50.82 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  48.48 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  45.16 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3218  Heavy metal transport/detoxification protein  51.72 
 
 
70 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  47.62 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  45.83 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1545  copper chaperone  40.62 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  45.76 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3377  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
66 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  46.03 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0204  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
856 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  52.38 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
833 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  48.33 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  54.84 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
1040 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
816 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
66 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
67 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  42.37 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
827 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  45.9 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18070  putative periplasmic metal-binding protein  45 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
833 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0752  copZ protein, putative  36.51 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
852 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0035  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
1013 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>