More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1664 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 366 aa  720    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  63.55 
 
 		 342 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  65.62 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  50.15 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  48.37 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  47.66 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  51.62 
 
 		 379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  47.43 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  45 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  43.62 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  39.78 
 
 		 356 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  38.02 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  37.72 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  35.6 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  35.6 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  37.13 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 		 351 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  35.17 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  37.18 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  37.22 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  33.75 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  36.22 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.7 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  34.42 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  32.7 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 358 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  34.46 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 		 337 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  34.34 
 
 		 347 aa  189  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  34.04 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 		 337 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 338 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  33.65 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.22 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.49 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  34.08 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  33.22 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  34.29 
 
 		 382 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 		 381 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  32.59 
 
 		 392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  37.31 
 
 		 423 aa  162  7e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  29.89 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  31.08 
 
 		 379 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2890  extracellular solute-binding protein family 1  30.91 
 
 		 360 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  32.51 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  32.16 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  31.86 
 
 		 342 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 335 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  30.63 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  31.02 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 339 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  31.42 
 
 		 345 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  32.08 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.68 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.69 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  32.04 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 333 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  32.68 
 
 		 326 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.64 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  27.24 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.77 
 
 		 336 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 333 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  28.75 
 
 		 334 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>