More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0970 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  100 
 
 		 425 aa  832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  51.85 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  50.13 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  47.22 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  49.88 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  44.11 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  47.99 
 
 		 412 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  45.41 
 
 		 415 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  47.37 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  48.4 
 
 		 447 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  43.74 
 
 		 441 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  44.44 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07350  isochorismate synthase family protein  43.69 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.120231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3233  isochorismate synthase  46.91 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.253442  normal  0.0166789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  42.86 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3133  isochorismate synthases  38.08 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  44.04 
 
 		 487 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24140  isochorismate synthase family protein  36.49 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.23 
 
 		 464 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.07 
 
 		 464 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.83 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  41.61 
 
 		 402 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.83 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  44.31 
 
 		 395 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.75 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.72 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.75 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.72 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  38.29 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.75 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.75 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  32.32 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21330  isochorismate synthase family protein  43.62 
 
 		 414 aa  186  8e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  38.11 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  41.86 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  41.76 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  36.19 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  34.45 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  42.86 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  41.76 
 
 		 398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  44.49 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  41.11 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  35.09 
 
 		 391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  39.33 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  38.22 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  45.82 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  34.12 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  35.33 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  39.47 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  41.8 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  41.8 
 
 		 391 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  40 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  37.97 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  37.97 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  40.71 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  35.6 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  37.97 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  37.97 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  37.97 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  37.59 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  37.59 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  42.21 
 
 		 451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  42.63 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  40.38 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  41.38 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  34.96 
 
 		 498 aa  163  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  37.22 
 
 		 399 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  28.57 
 
 		 473 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  35.63 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  38.3 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  40.74 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.19 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  36.43 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.18 
 
 		 481 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.75 
 
 		 484 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.75 
 
 		 492 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.32 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  44.27 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.13 
 
 		 483 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  41.15 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  38.08 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  44.14 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.35 
 
 		 484 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.52 
 
 		 481 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.01 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.01 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  32.21 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  42.28 
 
 		 383 aa  150  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  32.5 
 
 		 476 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  38.67 
 
 		 391 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  38.58 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  38.58 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  28.91 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  39.86 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  37.54 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  37.98 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.58 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.58 
 
 		 391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  34.56 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>