More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6039 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6039  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0868  PadR-like family transcriptional regulator  95.03 
 
 		 181 aa  320  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525718  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10046  hypothetical protein  90.61 
 
 		 180 aa  295  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5375  PadR family transcriptional regulator  92.94 
 
 		 181 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5464  PadR family transcriptional regulator  92.94 
 
 		 181 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5751  PadR family transcriptional regulator  92.94 
 
 		 181 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4747  transcriptional regulator PadR family protein  82.95 
 
 		 252 aa  264  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39320  transcriptional regulator, PadR family  70.29 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.700238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7032  transcriptional regulator, PadR-like family  71.19 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9364  transcriptional regulator protein-like protein  55.56 
 
 		 224 aa  205  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4957  transcriptional regulator, PadR-like family  57.54 
 
 		 212 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4194  transcriptional regulator, PadR-like family  71.91 
 
 		 199 aa  200  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5383  transcriptional regulator, PadR-like family  64.8 
 
 		 249 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3567  PadR-like family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.979058  normal  0.850546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7317  PadR-like family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 229 aa  190  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0346  transcriptional regulator, PadR-like family  55.81 
 
 		 201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824785  normal  0.03301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5073  transcriptional regulator, PadR-like family  54.44 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3702  transcriptional regulator, PadR-like family  56.07 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4562  transcriptional regulator PadR family protein  59.78 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.605184  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5080  PadR-like family transcriptional regulator  60 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.6626  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2137  PadR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37830  transcriptional regulator, PadR family  52 
 
 		 227 aa  176  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5920  transcriptional regulator, PadR-like family  59.44 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4677  PadR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2527  transcriptional regulator, PadR-like family  49.43 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4528  PadR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 272 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3358  transcriptional regulator, PadR-like family  45.83 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4200  transcriptional regulator, PadR-like family  49.43 
 
 		 209 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3510  transcriptional regulator, PadR-like family  45.18 
 
 		 198 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3098  PadR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 187 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1163  transcriptional regulator, PadR-like family  28 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.984047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3181  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000117068  hitchhiker  0.000000000506359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8023  transcriptional regulator protein-like protein  36.99 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4407  transcriptional regulator protein-like protein  30.86 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1535  transcriptional regulator, PadR-like family  30.81 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.918183  normal  0.0405313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4159  transcriptional regulator, PadR-like family  33.53 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  26.04 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0038  transcriptional regulator, PadR-like family  36.73 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  24.85 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  32.99 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  26.47 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  38.2 
 
 		 112 aa  57  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  22.49 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  22.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  22.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  22.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  22.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  36.79 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  26.53 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4689  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284032  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3827  transcriptional regulator, PadR-like family  29.48 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207978  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  31.4 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  41.46 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7568  transcriptional regulator, PadR-like family  40 
 
 		 277 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1365  transcriptional regulator, PadR-like family  39.53 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  35.9 
 
 		 111 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0379  transcriptional regulator, PadR-like family  32.58 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 116 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3678  transcriptional regulator, PadR-like family  42.03 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4102  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.615501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  30.13 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0184  PadR-like family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0475  transcriptional regulator, PadR family  36.71 
 
 		 109 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0876  PadR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.184962  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 114 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0106416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0503  transcriptional regulator, PadR-like family  26.67 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3551  transcriptional regulator, PadR-like family  26.47 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2179  PadR-like family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0782  PadR-like family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.661391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  34.48 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  35.56 
 
 		 114 aa  48.5  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3223  transcriptional regulator, PadR-like family  27.37 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  38.36 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  35.62 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  39.73 
 
 		 271 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 236 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  29.27 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  23.21 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1446  transcriptional regulator, PadR-like family  28.09 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  39.51 
 
 		 132 aa  48.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3685  transcriptional regulator, PadR-like family  31.21 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 118 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>