More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0879 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0879  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  321  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2100  AsnC family transcriptional regulator  58.06 
 
 
163 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3464  AsnC family transcriptional regulator  56.96 
 
 
163 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00420636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0186  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000683645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3193  AsnC family transcriptional regulator  52.87 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.680188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1415  transcriptional regulator, AsnC family  51.28 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0362  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2472  AsnC family transcriptional regulator  46.05 
 
 
163 aa  155  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0002  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 
163 aa  154  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00778678 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0047  transcriptional regulator, AsnC family  49.68 
 
 
162 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00562884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1152  AsnC family transcriptional regulator  48.05 
 
 
160 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1189  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 
167 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000169629  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1123  transcriptional regulator, AsnC family  48.05 
 
 
160 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0149  AsnC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
160 aa  151  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1341  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 
160 aa  147  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2209  transcriptional regulator, AsnC family  46.75 
 
 
159 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.928029  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  46.84 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1532  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2663  transcriptional regulator, AsnC family  46.79 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00226227  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0002  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
163 aa  144  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2183  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
162 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00948662  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0706  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0700  AsnC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4724  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3528  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
161 aa  137  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0541368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2404  transcriptional regulator, AsnC family  40.76 
 
 
165 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000668055  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2857  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
162 aa  135  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.301241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1206  AsnC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
162 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3534  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 
162 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5046  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3513  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 
164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0200  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5034  transcriptional regulator, AsnC family  45.22 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0638366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5041  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
165 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5013  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
165 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4772  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4612  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4634  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
168 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5134  AsnC family transcriptional regulator  44.59 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1320  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 
162 aa  127  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1770  transcriptional regulator, AsnC family  43.51 
 
 
161 aa  122  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000758756  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2838  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
162 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2862  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0002  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.85 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1694  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.43137  normal  0.666184 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  30.28 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  28.38 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 
153 aa  60.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
161 aa  60.5  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  31.82 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  28.26 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
148 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0435  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2516  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 
172 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  28.99 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  28.67 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
158 aa  57.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7223  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
154 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 
160 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  26.09 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2279  AsnC family transcriptional regulator  25.5 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  27.66 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.26 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  26.43 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  24.66 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  29.37 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  28.26 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.75 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>