More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3398 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  853    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  71.76 
 
 		 428 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  68.13 
 
 		 430 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  70.15 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  69.66 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  63.55 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  63.32 
 
 		 433 aa  542  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  63.55 
 
 		 433 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  57.32 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  57.87 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  56.66 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  58.98 
 
 		 435 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  59.28 
 
 		 434 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  52.48 
 
 		 439 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 455 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  52.37 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 423 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  52.17 
 
 		 423 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 430 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  50.81 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.25 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  50.35 
 
 		 430 aa  408  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.81 
 
 		 437 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.6 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 460 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4371  major facilitator transporter  50.44 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2672  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.529284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.44 
 
 		 443 aa  193  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 442 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  28.99 
 
 		 461 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  28.76 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  28.02 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 436 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  27.95 
 
 		 428 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  27.95 
 
 		 428 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  27.95 
 
 		 428 aa  180  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  28.28 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  27.71 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 426 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  30.5 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  29.62 
 
 		 468 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 444 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 450 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  31.82 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  31.58 
 
 		 456 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  28.75 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  29.2 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  29.45 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  29.38 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  29.45 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  29.45 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29 
 
 		 446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  29 
 
 		 446 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 455 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  29.37 
 
 		 444 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  30.17 
 
 		 436 aa  170  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 422 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  28.61 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  30.34 
 
 		 436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  30.05 
 
 		 450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  29.02 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  29.73 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  28.77 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  29.73 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  28.1 
 
 		 450 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>