More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4622 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
355 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  41.72 
 
 
341 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  46.45 
 
 
339 aa  252  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  42.12 
 
 
331 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  45.06 
 
 
353 aa  251  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  43.51 
 
 
330 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  46.27 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  43.45 
 
 
329 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
329 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  43.55 
 
 
329 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
343 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  34.26 
 
 
343 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  33.23 
 
 
352 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  32.28 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  34.04 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
355 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
331 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
358 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
352 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
389 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  31.46 
 
 
340 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
333 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.48 
 
 
822 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
360 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.08 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  28.72 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  23.92 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  28.46 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
752 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 
841 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  30.11 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27 
 
 
411 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  31.68 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  28.8 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  30.11 
 
 
300 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  48.61 
 
 
256 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  43.96 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
428 aa  60.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.35 
 
 
423 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26.67 
 
 
444 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.64 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26.67 
 
 
444 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26.67 
 
 
444 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.11 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
351 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  24.64 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
326 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
423 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
423 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  26.05 
 
 
423 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28.83 
 
 
1124 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.12 
 
 
451 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
789 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
789 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.7 
 
 
789 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  22.33 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  21.23 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
549 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
347 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
689 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
306 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  38.64 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  34.71 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.76 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
322 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0704  polyprenyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.04 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
528 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0808  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.04 
 
 
279 aa  53.5  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2369  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 
335 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
345 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
597 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.96 
 
 
380 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1197  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0797043  normal  0.230319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  29.13 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.85 
 
 
872 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
339 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
983 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 
1118 aa  52.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.7 
 
 
1157 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.37 
 
 
927 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.51 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.95 
 
 
421 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>