169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6863 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  100 
 
 		 529 aa  1053    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 370 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  32.01 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  25.31 
 
 		 426 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  25.42 
 
 		 434 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  25.19 
 
 		 436 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  26.3 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  24.11 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  26.9 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  24.8 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  24.8 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  24.4 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  29.09 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  29.09 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.65 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 415 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  39.13 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  31.3 
 
 		 501 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  26.65 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  41.94 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 816 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  39.68 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  28.68 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.22 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  27.42 
 
 		 455 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  27.62 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  39.33 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  27.53 
 
 		 429 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.31 
 
 		 195 aa  65.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  38.04 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  36.26 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  37.11 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  37.78 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  31.54 
 
 		 175 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  35.23 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.17 
 
 		 193 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  26.3 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.79 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  40 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.96 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 186 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  35.4 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 196 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.08 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  35.4 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  35.4 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.83 
 
 		 920 aa  57  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  35.35 
 
 		 177 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 192 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.78 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  33.71 
 
 		 213 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.28 
 
 		 375 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 921 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.35 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 185 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.35 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 185 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.67 
 
 		 220 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  32.52 
 
 		 153 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 347 aa  53.9  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  32.39 
 
 		 402 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 379 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 195 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 1055 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  28.45 
 
 		 184 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  35.87 
 
 		 246 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 919 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 912 aa  51.6  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.06 
 
 		 828 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.87 
 
 		 576 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  31.79 
 
 		 270 aa  51.2  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  23.42 
 
 		 417 aa  50.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  34.44 
 
 		 192 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 192 aa  50.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.5 
 
 		 352 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 185 aa  50.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 828 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.56 
 
 		 193 aa  50.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>