More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6049 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  58.5 
 
 		 819 aa  951    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  46.02 
 
 		 845 aa  683    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  57.65 
 
 		 809 aa  929    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  57.32 
 
 		 819 aa  932    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  46.68 
 
 		 840 aa  698    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  95.17 
 
 		 808 aa  1557    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  61.6 
 
 		 831 aa  1024    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  62.33 
 
 		 832 aa  984    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  44.96 
 
 		 849 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  66.75 
 
 		 803 aa  1113    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  54.85 
 
 		 831 aa  815    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  47.18 
 
 		 791 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  67.53 
 
 		 804 aa  1102    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  52.23 
 
 		 908 aa  807    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  61.63 
 
 		 830 aa  978    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  46.16 
 
 		 854 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  63.5 
 
 		 835 aa  1023    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  60.77 
 
 		 830 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  56.3 
 
 		 817 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  61.75 
 
 		 830 aa  992    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  61.89 
 
 		 843 aa  1016    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  57.32 
 
 		 819 aa  941    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 805 aa  1641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  45.82 
 
 		 835 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  86.96 
 
 		 805 aa  1411    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  44.9 
 
 		 849 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  57.26 
 
 		 818 aa  928    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  86.96 
 
 		 833 aa  1409    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  54.04 
 
 		 823 aa  889    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  87.89 
 
 		 805 aa  1411    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  86.84 
 
 		 810 aa  1422    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  62.02 
 
 		 804 aa  1027    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  45.23 
 
 		 849 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  52.7 
 
 		 833 aa  778    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  56.23 
 
 		 818 aa  902    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  58.5 
 
 		 819 aa  951    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  44.68 
 
 		 824 aa  631  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  44.43 
 
 		 838 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  42.82 
 
 		 844 aa  595  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.02 
 
 		 862 aa  540  9.999999999999999e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  39.22 
 
 		 795 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  41.49 
 
 		 904 aa  515  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 875 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 		 807 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  39.92 
 
 		 797 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  37.91 
 
 		 802 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 793 aa  496  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  38.78 
 
 		 777 aa  498  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  37.53 
 
 		 791 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  38.91 
 
 		 805 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 796 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  38.26 
 
 		 773 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 		 827 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  39.29 
 
 		 807 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  36.58 
 
 		 829 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.62 
 
 		 804 aa  492  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  38.67 
 
 		 792 aa  492  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.54 
 
 		 830 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.75 
 
 		 804 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 		 778 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  38.63 
 
 		 800 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  38.27 
 
 		 818 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 818 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  36.5 
 
 		 841 aa  480  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 797 aa  481  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  40.44 
 
 		 802 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  38.31 
 
 		 801 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  37.92 
 
 		 777 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.76 
 
 		 766 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  38.05 
 
 		 777 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  39.19 
 
 		 797 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 		 779 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.14 
 
 		 817 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 		 793 aa  474  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  37.36 
 
 		 803 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.11 
 
 		 791 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  36.7 
 
 		 817 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  38.08 
 
 		 778 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.33 
 
 		 815 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 		 824 aa  469  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 		 774 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 817 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  36.7 
 
 		 817 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 817 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  35.85 
 
 		 814 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 		 814 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 		 790 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  35.63 
 
 		 793 aa  462  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  34.8 
 
 		 823 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  36.98 
 
 		 771 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 		 814 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  36.87 
 
 		 807 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  38.4 
 
 		 778 aa  462  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  34.8 
 
 		 823 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  35.5 
 
 		 793 aa  459  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  37.37 
 
 		 796 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.31 
 
 		 799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  37.42 
 
 		 799 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  36.33 
 
 		 846 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>