225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4159 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
366 aa  722    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  80.33 
 
 
381 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  66.47 
 
 
355 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  65.68 
 
 
355 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  65.68 
 
 
355 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  63.82 
 
 
357 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  63.41 
 
 
366 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  52.11 
 
 
384 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  48.06 
 
 
353 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  48.96 
 
 
353 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  51.66 
 
 
353 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  50.46 
 
 
354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  48.36 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  44.44 
 
 
348 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  45.34 
 
 
360 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  50.83 
 
 
339 aa  277  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  38.1 
 
 
342 aa  144  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
365 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 
361 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  33.93 
 
 
335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  33.48 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  33.48 
 
 
358 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  32.52 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
339 aa  125  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 
357 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.87 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.4 
 
 
672 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.51 
 
 
658 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.63 
 
 
641 aa  67  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.46 
 
 
622 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 
632 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  27.83 
 
 
577 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.31 
 
 
744 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  27.94 
 
 
447 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.32 
 
 
483 aa  62.8  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.68 
 
 
483 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
645 aa  62.4  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  24.04 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
643 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.49 
 
 
701 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.95 
 
 
701 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.26 
 
 
723 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.49 
 
 
678 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.61 
 
 
725 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  24.1 
 
 
637 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
651 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  29.57 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.61 
 
 
723 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.46 
 
 
585 aa  59.3  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
410 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.4 
 
 
614 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1770  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
589 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.181318  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.09 
 
 
613 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.18 
 
 
650 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  26.97 
 
 
724 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  22.05 
 
 
641 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  28.95 
 
 
449 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
468 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
735 aa  57.4  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3943  adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 
592 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  24.86 
 
 
638 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.7 
 
 
753 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
464 aa  57  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 
407 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  23.23 
 
 
358 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
744 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.38 
 
 
757 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7104  adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.89 
 
 
665 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
712 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.66 
 
 
648 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  23.96 
 
 
701 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  27.23 
 
 
969 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  25.85 
 
 
859 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
729 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
367 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
421 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  26.84 
 
 
971 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4417  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
574 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.96 
 
 
618 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 
437 aa  53.5  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  24.73 
 
 
632 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
675 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>