More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0996 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 397 aa  801    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.11 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  47.07 
 
 		 386 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  46.81 
 
 		 386 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  51.08 
 
 		 394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  47.31 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.91 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  45.31 
 
 		 386 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.89 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  48.21 
 
 		 353 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  47.86 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  46.34 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  47.45 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  49.85 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  46.07 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  47.86 
 
 		 373 aa  325  9e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  46.65 
 
 		 382 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  46.65 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  46.09 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.09 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.82 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.11 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  44.01 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  47.08 
 
 		 400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.07 
 
 		 422 aa  318  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  45.73 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.63 
 
 		 378 aa  319  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  46.79 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.51 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  46.98 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  46.53 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  46.68 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.03 
 
 		 399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.88 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  47.47 
 
 		 381 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  45.85 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  45.75 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  47.44 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  44.8 
 
 		 395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  45.93 
 
 		 385 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  46.3 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  46.3 
 
 		 388 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  46.3 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  46.77 
 
 		 386 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  47.5 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  47.75 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  47.57 
 
 		 418 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  42.45 
 
 		 385 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.7 
 
 		 395 aa  301  9e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.35 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  45.08 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  47.01 
 
 		 412 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  47.76 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  45.1 
 
 		 379 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  46.85 
 
 		 384 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.37 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  48.99 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  44.27 
 
 		 450 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  47.01 
 
 		 412 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2512  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.19 
 
 		 383 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.83 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  44.84 
 
 		 417 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  44.33 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  43.97 
 
 		 383 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  43.27 
 
 		 382 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  48.7 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  47.8 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  46.94 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  46.94 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  46.94 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  45.83 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  45.48 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  48.7 
 
 		 412 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  46.39 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  44.88 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  46.26 
 
 		 387 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  47.35 
 
 		 386 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  43.09 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.9 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  43.92 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  47.56 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  43.99 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.99 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  43.99 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  43.99 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  43.99 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  43.99 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  43.99 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>