More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0053 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0053  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 325 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3198  dihydrodipicolinate synthetase  79.05 
 
 		 319 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0239  dihydrodipicolinate synthase family protein  72.38 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0560064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0218  dihydrodipicolinate synthase family protein  72.06 
 
 		 320 aa  471  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5868  dihydrodipicolinate synthetase  71.01 
 
 		 313 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2898  dihydrodipicolinate synthetase  72.49 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6107  dihydrodipicolinate synthetase  70.68 
 
 		 313 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6384  Dihydrodipicolinate synthase  70.25 
 
 		 322 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3873  dihydrodipicolinate synthetase  70.79 
 
 		 320 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5097  dihydrodipicolinate synthetase  68.3 
 
 		 314 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5988  dihydrodipicolinate synthetase  70 
 
 		 313 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00739059  normal  0.0645326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4867  dihydrodipicolinate synthase  66.98 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619705 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5576  dihydrodipicolinate synthase  70.43 
 
 		 313 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1257  dihydrodipicolinate synthase family protein  68.49 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1284  dihydrodipicolinate synthetase  68.49 
 
 		 315 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.755784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2307  dihydrodipicolinate synthetase  69.16 
 
 		 315 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2706  dihydrodipicolinate synthetase  68.63 
 
 		 315 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3970  dihydrodipicolinate synthetase  68.83 
 
 		 314 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4134  dihydrodipicolinate synthetase  68.83 
 
 		 315 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1969  dihydrodipicolinate synthase  63.99 
 
 		 317 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  32.75 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  33.48 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  30.92 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  29.71 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  31.84 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  28.03 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  29.64 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  29.81 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  28.79 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  28.79 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  28.79 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  28.79 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  27.84 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  30.48 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  32.53 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.99 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.24 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  29.49 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.61 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  28.73 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  28.95 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  28.01 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  31.33 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  26.57 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  28.16 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  26.82 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.9 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  30.16 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  31.36 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  30.09 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1273  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3509  dihydrodipicolinate synthase  30.74 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  28.36 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  28.57 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  27.9 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.7 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  27.6 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  33.06 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  31.28 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  26.89 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1247  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  28.21 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3132  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1362  dihydrodipicolinate synthase  30.08 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.147738  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1046  dihydrodipicolinate synthetase  28.78 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  29.79 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  30.18 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  31.46 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3179  dihydrodipicolinate synthase  30.33 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0330313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2066  dihydrodipicolinate synthetase  29.57 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  25.65 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  29.96 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.09 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1139  dihydrodipicolinate synthase  29.92 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  32.19 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 291 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  32.77 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.17 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  27.17 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  27.94 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  29.81 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  32.93 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>