More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6384 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6384  Dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 322 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956523 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0239  dihydrodipicolinate synthase family protein  88.75 
 
 		 320 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0560064  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0218  dihydrodipicolinate synthase family protein  88.12 
 
 		 320 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3873  dihydrodipicolinate synthetase  87.19 
 
 		 320 aa  554  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2898  dihydrodipicolinate synthetase  77.19 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6107  dihydrodipicolinate synthetase  75.48 
 
 		 313 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5868  dihydrodipicolinate synthetase  75.48 
 
 		 313 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5097  dihydrodipicolinate synthetase  74.52 
 
 		 314 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3198  dihydrodipicolinate synthetase  70.35 
 
 		 319 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0053  dihydrodipicolinate synthase  70.25 
 
 		 325 aa  478  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5988  dihydrodipicolinate synthetase  74.44 
 
 		 313 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00739059  normal  0.0645326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2307  dihydrodipicolinate synthetase  74.43 
 
 		 315 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4867  dihydrodipicolinate synthase  73.75 
 
 		 320 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2706  dihydrodipicolinate synthetase  73.14 
 
 		 315 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1257  dihydrodipicolinate synthase family protein  72.17 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.326505  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1284  dihydrodipicolinate synthetase  72.17 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.755784 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5576  dihydrodipicolinate synthase  70.82 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4134  dihydrodipicolinate synthetase  71.52 
 
 		 315 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3970  dihydrodipicolinate synthetase  71.66 
 
 		 314 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.303962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1969  dihydrodipicolinate synthase  69.93 
 
 		 317 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  31.62 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  33.48 
 
 		 293 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  30.9 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  31.25 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  28.03 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  30.82 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.34 
 
 		 390 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0471  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.230388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0568  dihydrodipicolinate synthetase  31.34 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.397945  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.34 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  31.37 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.34 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  29.35 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0879  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.34 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  28.81 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1886  hypothetical protein  31.34 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  28.9 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2568  dihydrodipicolinate synthetase  31.37 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  30.18 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  32.17 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.97 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  29.15 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  33.73 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  26.91 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  29.71 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.68 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  30.21 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  32.47 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  30.2 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  30.21 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  33.2 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  28.07 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  28.93 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  33.05 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  28.32 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  28.76 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  30.25 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.84 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  30.26 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4138  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.89 
 
 		 305 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  30.7 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48000  putative dihydrodipicolinate synthetase  29.89 
 
 		 305 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00397266  normal  0.801152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2308  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.44 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  29.78 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  28.02 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.88 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  26.64 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  33.21 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  27.11 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  30.17 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  29.41 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  28.89 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  31.22 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  31.75 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  26.37 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  31.35 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  28.95 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  30.77 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0526  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.92 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  32.13 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  28.44 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  28.44 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  26.47 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>