162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1577 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  785    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  65.17 
 
 		 378 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  57.89 
 
 		 368 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  54.36 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  49.47 
 
 		 370 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  43.01 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  42.2 
 
 		 363 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  41.67 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  41.22 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  40.96 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  43.2 
 
 		 357 aa  280  4e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  41.67 
 
 		 362 aa  279  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  41.21 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  41.21 
 
 		 367 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  39.78 
 
 		 365 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  40.94 
 
 		 369 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  38.31 
 
 		 416 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  40.91 
 
 		 373 aa  258  9e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  38.95 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  38.03 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  38.16 
 
 		 369 aa  234  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  36.98 
 
 		 384 aa  226  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  37.92 
 
 		 370 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  32.89 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  27.89 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.73 
 
 		 409 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  25.81 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  25.81 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  28.68 
 
 		 398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.7 
 
 		 395 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.25 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  28.5 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  25.62 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  26.67 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  25.94 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  28.53 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  28.65 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  36.81 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  26.58 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  26.67 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  25 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  26.24 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  26.22 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  27.25 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  25.98 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  26.98 
 
 		 387 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  25.75 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  24.06 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  25.2 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  26.85 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  28.46 
 
 		 410 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  23.06 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  31.16 
 
 		 226 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.59 
 
 		 361 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  25.32 
 
 		 385 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  23.06 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.99 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  22.5 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  23.27 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  46.59 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  33.73 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  21.55 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  30.73 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  24.88 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  25.69 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  22.44 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  23.59 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  22.95 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  22.34 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  22.33 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  25.99 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  21.29 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  39.25 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  29.58 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  29.58 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  29.58 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  29.58 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  29.58 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  29.58 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  29.58 
 
 		 392 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  46.05 
 
 		 386 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  22.4 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  23.58 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  22.96 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3600  ATPase-like protein  24.03 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  23.99 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  31.33 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  25.12 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  38.1 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  26.83 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  26.83 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  26.83 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  25.77 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  31.21 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  33.64 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  34.09 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  28.26 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  28.26 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>