43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0336 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  35.88 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  36.11 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  37.89 
 
 		 646 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  36.84 
 
 		 772 aa  65.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  31.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  38.55 
 
 		 251 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  27.34 
 
 		 1737 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  35.35 
 
 		 507 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  36.54 
 
 		 776 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 465 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.25 
 
 		 729 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 911 aa  53.9  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  33.03 
 
 		 1063 aa  53.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  31.36 
 
 		 984 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  26.83 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  31.37 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 756 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  30.84 
 
 		 768 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  36.56 
 
 		 299 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.2 
 
 		 841 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  30.77 
 
 		 785 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  41.3 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  30 
 
 		 1171 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 651 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  27.45 
 
 		 805 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.52 
 
 		 922 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  30.43 
 
 		 1091 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  29.29 
 
 		 724 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  27.5 
 
 		 1097 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5679  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.714898  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  29.27 
 
 		 468 aa  45.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0744  putative secreted protein  28.36 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  29.67 
 
 		 883 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 		 1013 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1852  hypothetical protein  25.78 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.108862  hitchhiker  0.00107714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  26.26 
 
 		 503 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  24.8 
 
 		 1046 aa  42  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  28.06 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2160  fatty acid cistrans isomerase  33.85 
 
 		 758 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.279202  normal  0.0207501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  29.59 
 
 		 922 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>