19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1852 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.108862  hitchhiker  0.00107714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  28.43 
 
 		 756 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  28.15 
 
 		 772 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  29.59 
 
 		 646 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  27.61 
 
 		 1129 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  33.64 
 
 		 776 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  31.07 
 
 		 765 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  31.96 
 
 		 724 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  29.09 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  26.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  29.25 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  27.42 
 
 		 484 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5681  hypothetical protein  27.08 
 
 		 223 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  32.71 
 
 		 1063 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  28.57 
 
 		 465 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  28.57 
 
 		 729 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.86 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  29.36 
 
 		 716 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  23.65 
 
 		 1066 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>