More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0049 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0049  ribonuclease III  100 
 
 
229 aa  450  1e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0774  ribonuclease III  91.27 
 
 
229 aa  416  1e-115  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.811993  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1144  ribonuclease III  89.96 
 
 
229 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0839  ribonuclease III  71.24 
 
 
227 aa  325  5e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1347  ribonuclease III  47.03 
 
 
241 aa  212  3e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.461222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  49.33 
 
 
246 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  47.73 
 
 
246 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2501  ribonuclease III  47.79 
 
 
245 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00121317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3948  ribonuclease III  47.53 
 
 
245 aa  185  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.399561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1295  ribonuclease III  47.53 
 
 
245 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0290325  hitchhiker  3.99354e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3863  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2755e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3897  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.42133e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3700  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3987  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.484862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3590  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3891  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3608  ribonuclease III  47.35 
 
 
245 aa  184  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3672  ribonuclease III  46.19 
 
 
245 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.405617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  43.05 
 
 
246 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1292  ribonuclease III  41.92 
 
 
243 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1317  ribonuclease III  41.92 
 
 
243 aa  180  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0799  ribonuclease III  42.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.807465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  44.14 
 
 
229 aa  179  3e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  45.33 
 
 
236 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.94117e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  43.84 
 
 
235 aa  179  5e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  48.15 
 
 
236 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  42.11 
 
 
259 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.92839e-05  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  43.48 
 
 
236 aa  173  2e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1159  ribonuclease III  40.44 
 
 
233 aa  171  6e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  3.32232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0862  ribonuclease III  41.36 
 
 
231 aa  171  7e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  41.55 
 
 
233 aa  170  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  40.89 
 
 
235 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  37.44 
 
 
235 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  42.54 
 
 
233 aa  162  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  43.52 
 
 
236 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  39.15 
 
 
246 aa  158  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  43.61 
 
 
245 aa  157  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  42.92 
 
 
246 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  38.43 
 
 
262 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.19761e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  40.09 
 
 
241 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  40.09 
 
 
241 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  41.18 
 
 
240 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  40.79 
 
 
230 aa  152  3e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.82904e-05  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  43.6 
 
 
246 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  1.53417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  35.62 
 
 
232 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  7.49592e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  32.76 
 
 
234 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  44.76 
 
 
253 aa  147  2e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  37.28 
 
 
237 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  42.57 
 
 
282 aa  145  7e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  39.81 
 
 
231 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  39.45 
 
 
231 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  36.84 
 
 
248 aa  141  1e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  3.34707e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1714  ribonuclease III  38.26 
 
 
240 aa  141  1e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4602  ribonuclease III  32.26 
 
 
237 aa  140  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  34.8 
 
 
240 aa  140  2e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  40.27 
 
 
238 aa  140  2e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1708  ribonuclease III  39.3 
 
 
229 aa  139  4e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  33.04 
 
 
240 aa  139  5e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  35.53 
 
 
248 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  6.40181e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  35.43 
 
 
246 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  36.89 
 
 
232 aa  138  9e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0243  ribonuclease III  35.93 
 
 
230 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0530001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  40.09 
 
 
242 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0659  ribonuclease III  39.53 
 
 
239 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0117044  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  37.73 
 
 
221 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  35.59 
 
 
225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  35.59 
 
 
225 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  41.75 
 
 
248 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  38.22 
 
 
232 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  35.22 
 
 
230 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  34.84 
 
 
239 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  35.87 
 
 
234 aa  136  3e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1641  ribonuclease III  37.18 
 
 
240 aa  136  3e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  40.71 
 
 
222 aa  136  3e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1626  ribonuclease III  41.92 
 
 
225 aa  135  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1588  ribonuclease III  36.02 
 
 
234 aa  135  6e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1995  ribonuclease III  41.48 
 
 
225 aa  135  7e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1807  ribonuclease III  41.48 
 
 
224 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  36.89 
 
 
252 aa  134  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  35.38 
 
 
276 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0453  ribonuclease III  36.16 
 
 
231 aa  134  1e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  39.65 
 
 
306 aa  133  2e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1714  Ribonuclease III  38.12 
 
 
229 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.61541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  36.54 
 
 
276 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1639  ribonuclease III  34.35 
 
 
228 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277384  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  36.36 
 
 
250 aa  132  4e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  37.14 
 
 
383 aa  132  4e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  39.11 
 
 
267 aa  132  4e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1565  ribonuclease III  36.28 
 
 
236 aa  132  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  36.97 
 
 
383 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  32.58 
 
 
260 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  37.11 
 
 
224 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  40.8 
 
 
268 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl231  ribonuclease III, dsRNA-specific ribonuclease  39.09 
 
 
231 aa  131  1e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  36.67 
 
 
385 aa  130  2e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2024  ribonuclease III  40.53 
 
 
226 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2029  ribonuclease III  36.07 
 
 
222 aa  129  4e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0184754  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  35.59 
 
 
377 aa  129  5e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  37.16 
 
 
241 aa  128  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  33.9 
 
 
246 aa  128  7e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>