More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0081 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 333 aa  683    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  65.66 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  63.55 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  62.95 
 
 		 337 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  64.16 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  53.31 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  51.2 
 
 		 337 aa  338  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  50.59 
 
 		 340 aa  333  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  49.85 
 
 		 334 aa  332  5e-90  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  49.55 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  49.55 
 
 		 334 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  54.08 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  49.4 
 
 		 338 aa  322  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  48.35 
 
 		 334 aa  321  9.000000000000001e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  50 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  48.8 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  48.8 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  49.25 
 
 		 340 aa  315  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  48.65 
 
 		 333 aa  315  8e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  45.4 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  46.01 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  45.88 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  42.36 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  45.26 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  45.69 
 
 		 338 aa  261  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  40.65 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.91 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  35.98 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.51 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  36.28 
 
 		 390 aa  186  3e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  33.42 
 
 		 392 aa  182  8.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  34.62 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  31.49 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  29.96 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  28.07 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  26.16 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  29.26 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0842  ribosomal protein L3  33.85 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  28.62 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  27.5 
 
 		 211 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  35.71 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  27.4 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  29.31 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  26.5 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  35.26 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  27.6 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  36.22 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  26.35 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  28 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  27.9 
 
 		 211 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  27.17 
 
 		 210 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0494  50S ribosomal protein L3  28 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000368377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  26.74 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  26.28 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  27.74 
 
 		 209 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  28.18 
 
 		 211 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  27.37 
 
 		 209 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  27.9 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  29.87 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  26.62 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  27.86 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  27.86 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  25.72 
 
 		 208 aa  65.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  32.09 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  33.33 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  28.16 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  25.36 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  35.43 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  26.64 
 
 		 209 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  26.98 
 
 		 218 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  30.71 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  28.21 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  28.21 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  28.47 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  28.21 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  28.16 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  27.44 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  30.6 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  26.45 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  31.47 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  28.16 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  25.18 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  28.99 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  30 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  26.55 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385888  normal  0.0180173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>