More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2930 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  100 
 
 		 606 aa  1230    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  63.29 
 
 		 620 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  72.19 
 
 		 583 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  71.9 
 
 		 543 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  72.19 
 
 		 583 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  37.87 
 
 		 582 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  38.32 
 
 		 576 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  37.05 
 
 		 560 aa  350  6e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  36.27 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  33.58 
 
 		 574 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  32.47 
 
 		 569 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  30.84 
 
 		 603 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  31.96 
 
 		 616 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  34 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  34.18 
 
 		 542 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  34.01 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  33.9 
 
 		 541 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 573 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 596 aa  231  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  33.1 
 
 		 564 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.77 
 
 		 575 aa  223  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.43 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  32.79 
 
 		 532 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.16 
 
 		 575 aa  217  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.93 
 
 		 608 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.61 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.64 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 558 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 573 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  32.43 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 555 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  33.27 
 
 		 560 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.31 
 
 		 530 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 538 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  30.13 
 
 		 546 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  29 
 
 		 553 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.73 
 
 		 543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.45 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 569 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.59 
 
 		 547 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.52 
 
 		 553 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.65 
 
 		 556 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 552 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.68 
 
 		 579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.74 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  30.83 
 
 		 576 aa  184  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.17 
 
 		 564 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 548 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 548 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 556 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.72 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  30.66 
 
 		 548 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  28.62 
 
 		 560 aa  181  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  30.35 
 
 		 601 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.79 
 
 		 552 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 583 aa  179  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  29.17 
 
 		 580 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  31 
 
 		 565 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  30.37 
 
 		 574 aa  178  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 589 aa  178  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  26.42 
 
 		 568 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 556 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 580 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.46 
 
 		 550 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  28.72 
 
 		 543 aa  177  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 601 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  29.14 
 
 		 536 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.92 
 
 		 557 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  29.12 
 
 		 568 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 551 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.39 
 
 		 539 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.63 
 
 		 544 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.94 
 
 		 522 aa  171  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  29.16 
 
 		 541 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  28.75 
 
 		 580 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 583 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 590 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  28.14 
 
 		 550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.71 
 
 		 562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1631  Amidohydrolase 3  30.99 
 
 		 537 aa  163  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0506733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.57 
 
 		 539 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.61 
 
 		 550 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  28.67 
 
 		 529 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 565 aa  160  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 564 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>