More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1529 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  68.12 
 
 		 935 aa  1196    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  57.24 
 
 		 927 aa  973    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  57.02 
 
 		 927 aa  974    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  57.76 
 
 		 888 aa  993    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  57.11 
 
 		 937 aa  979    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  76.06 
 
 		 921 aa  1308    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.55 
 
 		 942 aa  738    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  57.22 
 
 		 934 aa  998    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  56.87 
 
 		 934 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  57.68 
 
 		 922 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  57.6 
 
 		 937 aa  985    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 916 aa  1811    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  57.13 
 
 		 925 aa  983    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  57.31 
 
 		 911 aa  976    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  99.45 
 
 		 916 aa  1802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  90.92 
 
 		 921 aa  1592    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  71.19 
 
 		 878 aa  1251    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40.72 
 
 		 910 aa  619  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  49.28 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  43.15 
 
 		 766 aa  559  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 796 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.59 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 728 aa  458  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  45.54 
 
 		 742 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 1063 aa  459  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 792 aa  442  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 760 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30990  chemotaxis protein histidine kinase-like protein  44.55 
 
 		 819 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  47.25 
 
 		 870 aa  419  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 		 822 aa  414  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  40.47 
 
 		 769 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  40.47 
 
 		 769 aa  411  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  34.54 
 
 		 1104 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.91 
 
 		 769 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.66 
 
 		 770 aa  404  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  39.06 
 
 		 774 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  34.59 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  38.72 
 
 		 785 aa  382  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.58 
 
 		 783 aa  379  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 770 aa  365  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 598 aa  362  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 666 aa  361  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  47.52 
 
 		 770 aa  358  2.9999999999999997e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 607 aa  355  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 604 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  35.33 
 
 		 610 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 603 aa  350  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 650 aa  349  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  34.76 
 
 		 601 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 1031 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 694 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 652 aa  327  5e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  34.87 
 
 		 625 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.6 
 
 		 639 aa  327  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  38.65 
 
 		 806 aa  325  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  33.87 
 
 		 685 aa  323  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  31.12 
 
 		 702 aa  318  2e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 713 aa  318  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 747 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 812 aa  317  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0174  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 919 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00798527  normal  0.714787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0113  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 686 aa  314  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0734  CheA signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 920 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.424907  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  35.51 
 
 		 639 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 919 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  34.78 
 
 		 674 aa  311  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0942  CheA signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 670 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 681 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0166  CheA signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 677 aa  308  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 		 871 aa  308  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  38.12 
 
 		 751 aa  308  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 687 aa  308  4.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  42.31 
 
 		 744 aa  308  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0220  CheA signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 957 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0106413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.55 
 
 		 767 aa  306  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  38.07 
 
 		 736 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  31.56 
 
 		 702 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.64 
 
 		 654 aa  304  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  39.9 
 
 		 1089 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 701 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 954 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0186  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 688 aa  303  9e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 		 697 aa  303  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 746 aa  303  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 747 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.49 
 
 		 654 aa  302  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  33.77 
 
 		 681 aa  302  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 655 aa  302  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  36.22 
 
 		 720 aa  302  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41 
 
 		 754 aa  302  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 691 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  31.32 
 
 		 714 aa  301  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 673 aa  301  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.64 
 
 		 654 aa  301  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  39.24 
 
 		 760 aa  301  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.64 
 
 		 652 aa  301  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 738 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.49 
 
 		 652 aa  301  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>