More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0703 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  97.79 
 
 		 409 aa  703    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  774    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  47.24 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  47.11 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  48.27 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  44.64 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  43.58 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  43.53 
 
 		 403 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  44.07 
 
 		 412 aa  324  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 410 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  44.03 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  43 
 
 		 417 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 406 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 405 aa  319  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 408 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  44.86 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  47 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  46.57 
 
 		 402 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 410 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  47.89 
 
 		 402 aa  308  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  46.91 
 
 		 400 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 408 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  46.33 
 
 		 480 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 417 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 412 aa  302  7.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 407 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  49.11 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 405 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 408 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  48.86 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 436 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  43.18 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  44.12 
 
 		 528 aa  292  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  42.05 
 
 		 413 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 405 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  41.5 
 
 		 411 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 411 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  45.1 
 
 		 398 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  37.25 
 
 		 421 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  42.11 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 433 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 412 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 415 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  39.53 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 414 aa  219  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 389 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  35.49 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 452 aa  136  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 436 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.59 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  31.02 
 
 		 432 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.31 
 
 		 433 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.71 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  29.71 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>