187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3169 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 334 aa  679    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  42.45 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  41.1 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  42.41 
 
 		 345 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  42.05 
 
 		 488 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  42.05 
 
 		 488 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  39.16 
 
 		 505 aa  210  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  39.42 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  31.54 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  32.42 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  31.1 
 
 		 329 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  31.01 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  31.33 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  30.34 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  31.25 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  28.79 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  29.94 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  29.18 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  26.67 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  27.27 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  36.09 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  37.67 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  33.88 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  31.65 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  37.38 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  32.41 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  28.28 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  26.55 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.3 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  35.14 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  29.03 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  30.71 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  30.71 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  32.63 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  26.67 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  30.25 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  25.45 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  30 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  27.93 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  27.1 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  29.46 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  29.46 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  31.63 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  27.1 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  27.1 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  26.17 
 
 		 272 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  26.17 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  31.37 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  28.1 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  30.25 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  26.32 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  27.72 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  27.1 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  27.37 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  28.46 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  29.09 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  25.2 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.59 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  25.86 
 
 		 262 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  24.56 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  28.26 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  29.41 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1900  hypothetical protein  29.2 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.311417  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  27.03 
 
 		 229 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  26.27 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  27.78 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  29.41 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  26.09 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  25.62 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  28.18 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  25.23 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2363  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.574477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>