More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1061 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 242 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  41.78 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 218 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 230 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  39.7 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  39.2 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  42.29 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  41.9 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 214 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 224 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3247  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 226 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2481  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  35.29 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.81 
 
 		 222 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 253 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  31.35 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  30.98 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>