More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0953 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  810    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  76.46 
 
 		 412 aa  578  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  50.25 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  51.63 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  49.13 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 417 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 403 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 406 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  47.46 
 
 		 405 aa  348  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  47.46 
 
 		 405 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  46.8 
 
 		 412 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  45 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 410 aa  342  9e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  45.62 
 
 		 413 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 402 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  46.84 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 408 aa  326  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 406 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  47.16 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  46.27 
 
 		 430 aa  318  9e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  45.29 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  43.83 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  46.98 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  47.23 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 433 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  46.88 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  40.68 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  43.22 
 
 		 410 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 		 408 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 410 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 410 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 410 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 401 aa  299  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  42.67 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 404 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 		 416 aa  294  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 408 aa  292  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  42.25 
 
 		 411 aa  292  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 411 aa  285  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 410 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 409 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  42.08 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  42.22 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  42.64 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  42.49 
 
 		 398 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 414 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 415 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 403 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  38.24 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  35.64 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 422 aa  153  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  29.88 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  30.05 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4080  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  29 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  26.49 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  28.41 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3837  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.6 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>