More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1950 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 892 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 892 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  43.06 
 
 		 856 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.55 
 
 		 858 aa  716    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  45.48 
 
 		 871 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  41.12 
 
 		 891 aa  641    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  46.47 
 
 		 898 aa  697    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  38.62 
 
 		 873 aa  644    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.57 
 
 		 891 aa  685    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 		 896 aa  751    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.56 
 
 		 892 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 872 aa  1771    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 928 aa  664    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 		 851 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.75 
 
 		 868 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 892 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 890 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  39.36 
 
 		 894 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  47.26 
 
 		 932 aa  763    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 858 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  39.98 
 
 		 895 aa  652    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  46.54 
 
 		 865 aa  702    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.97 
 
 		 867 aa  720    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 881 aa  679    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  42.32 
 
 		 864 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.25 
 
 		 863 aa  637    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  53.39 
 
 		 900 aa  923    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  41.74 
 
 		 910 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.19 
 
 		 868 aa  725    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.65 
 
 		 837 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 		 855 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 863 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  44.46 
 
 		 880 aa  658    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 872 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  46.52 
 
 		 870 aa  725    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.37 
 
 		 828 aa  675    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  53.77 
 
 		 864 aa  862    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.69 
 
 		 897 aa  727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.58 
 
 		 872 aa  693    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  41.82 
 
 		 904 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  43.48 
 
 		 875 aa  657    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 892 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.82 
 
 		 870 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 856 aa  647    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  46.12 
 
 		 873 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.58 
 
 		 882 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  48.06 
 
 		 863 aa  718    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 		 871 aa  645    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38.88 
 
 		 872 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  55.02 
 
 		 892 aa  920    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  45.29 
 
 		 872 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  40.59 
 
 		 863 aa  660    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  44.61 
 
 		 903 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  59.52 
 
 		 903 aa  968    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.59 
 
 		 856 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 		 870 aa  743    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  46.9 
 
 		 869 aa  799    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  52.9 
 
 		 887 aa  939    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 856 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 853 aa  693    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.76 
 
 		 862 aa  733    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.41 
 
 		 859 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 855 aa  652    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  43.13 
 
 		 882 aa  682    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 890 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.15 
 
 		 863 aa  680    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 871 aa  636    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  44.62 
 
 		 869 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40 
 
 		 869 aa  638    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.14 
 
 		 860 aa  680    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  41.67 
 
 		 886 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  44.49 
 
 		 910 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  44.14 
 
 		 910 aa  690    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.75 
 
 		 872 aa  703    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.5 
 
 		 878 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 		 861 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.86 
 
 		 878 aa  643    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42 
 
 		 861 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.18 
 
 		 859 aa  707    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 872 aa  655    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.56 
 
 		 858 aa  721    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.39 
 
 		 855 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  45.22 
 
 		 850 aa  668    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  58.94 
 
 		 874 aa  1004    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 		 856 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 890 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  46.27 
 
 		 858 aa  712    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 		 857 aa  712    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 889 aa  665    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 868 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 861 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  42.16 
 
 		 855 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  42.28 
 
 		 855 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 		 854 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 		 881 aa  633  1e-180  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.78 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 884 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  42.91 
 
 		 884 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 861 aa  635  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>