More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3566 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3566  dipeptide/oligopeptide-binding protein  100 
 
 		 562 aa  1156    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.672958  normal  0.0864129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0328  extracellular solute-binding protein family 5  46.36 
 
 		 540 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2629  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  37.3 
 
 		 517 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000968343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0785  extracellular solute-binding protein  38.25 
 
 		 512 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0600833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  32.72 
 
 		 588 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0343  extracellular solute-binding protein family 5  33.06 
 
 		 537 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.21 
 
 		 516 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  27.31 
 
 		 519 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1494  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.54 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0931394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1284  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 543 aa  177  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1270  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.67 
 
 		 542 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.593504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0038  extracellular solute-binding protein family 5  28.8 
 
 		 568 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 555 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  30.57 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1038  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.43 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2377  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 516 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.35 
 
 		 510 aa  161  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.22 
 
 		 545 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  28.51 
 
 		 575 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  28.51 
 
 		 575 aa  158  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.16 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.86 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2073  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0694715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1615  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.92 
 
 		 587 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0482  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0312851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2761  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.39 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0902479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6684  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.692475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 		 535 aa  154  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.49 
 
 		 535 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  28.79 
 
 		 513 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 575 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  27.67 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.29 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 		 551 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.63 
 
 		 567 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  31.95 
 
 		 510 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5780  extracellular solute-binding protein family 5  28.27 
 
 		 548 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0222518  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.75 
 
 		 524 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.27 
 
 		 566 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0473  nickel ABC transporter, solute-binding protein  28.25 
 
 		 538 aa  150  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.35 
 
 		 513 aa  150  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 535 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 		 575 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.59 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.27 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1345  dipeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.88 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.932628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  27.27 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  27.27 
 
 		 535 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.54 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3798  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0239  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0886528  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3760  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.51 
 
 		 524 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 		 557 aa  147  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.02 
 
 		 526 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 575 aa  146  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 536 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.02 
 
 		 526 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.48 
 
 		 538 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3675  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.29 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3221  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 517 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2745  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 551 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3958  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.29 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0240  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.29 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 565 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0331  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 542 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.18 
 
 		 536 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 529 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  30.91 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.91 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.66 
 
 		 556 aa  144  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4816  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein NikA  27.07 
 
 		 524 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 567 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>