More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1084 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2346  thermosome  65.92 
 
 		 553 aa  674    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1287  thermosome  60.04 
 
 		 551 aa  635    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1084  Hsp60  100 
 
 		 543 aa  1083    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1201  Hsp60  69.49 
 
 		 555 aa  749    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0032  thermosome  66.73 
 
 		 551 aa  677    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2549  thermosome  66.16 
 
 		 552 aa  673    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.143505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1131  thermosome  60.59 
 
 		 539 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.318875  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1960  thermosome subunit, group II chaperonin  69.01 
 
 		 500 aa  699    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2146  thermosome, chaperonin Cpn60/TCP-1  66.73 
 
 		 542 aa  714    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0199  thermosome  68.44 
 
 		 552 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.730772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0769  thermosome  65.84 
 
 		 543 aa  697    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0206  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  64.78 
 
 		 551 aa  666    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.609669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0916  thermosome  59.27 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1270  thermosome  58.62 
 
 		 559 aa  617  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0315  thermosome  60.23 
 
 		 547 aa  611  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0828  thermosome  58.35 
 
 		 543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1157  thermosome  57.58 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0060  thermosome  57.39 
 
 		 545 aa  599  1e-170  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.869644  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0699  thermosome  56.7 
 
 		 558 aa  595  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.758666  normal  0.97393 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0761  thermosome  57.58 
 
 		 542 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2095  thermosome  55.89 
 
 		 557 aa  596  1e-169  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1023  thermosome  55.49 
 
 		 543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2662  thermosome  55.36 
 
 		 563 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0291  thermosome  53.55 
 
 		 545 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00322261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1792  thermosome  53.64 
 
 		 570 aa  568  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0693  thermosome  53.76 
 
 		 553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.540733  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3659  thermosome  55.96 
 
 		 558 aa  560  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1258  thermosome  52.02 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0027  thermosome  51.44 
 
 		 557 aa  542  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.196401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2264  thermosome  51.45 
 
 		 553 aa  536  1e-151  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.802406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0971  thermosome  51.05 
 
 		 552 aa  531  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.497136  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0271  chaperonin Cpn60/TCP-1  51.23 
 
 		 529 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.25851  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1577  thermosome  49.04 
 
 		 540 aa  527  1e-148  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1469  thermosome  49.71 
 
 		 554 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1323  thermosome  51.92 
 
 		 548 aa  522  1e-147  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.678735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2395  chaperonin Cpn60/TCP-1  50.76 
 
 		 530 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.418738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0320  chaperonin Cpn60/TCP-1  49.07 
 
 		 536 aa  519  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.659362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0733  thermosome  52.14 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.331529  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0501  thermosome  50.48 
 
 		 560 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41409 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0958  thermosome  52.5 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1052  thermosome subunit  52.12 
 
 		 549 aa  513  1e-144  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1704  thermosome  49.9 
 
 		 558 aa  508  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.52837 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2135  thermosome  52.12 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3025  thermosome  51.25 
 
 		 561 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0007  thermosome  47.46 
 
 		 558 aa  507  9.999999999999999e-143  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1525  thermosome  50.67 
 
 		 553 aa  502  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.360658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1771  thermosome subunit  50.58 
 
 		 554 aa  503  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000503304 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1851  thermosome  47.61 
 
 		 559 aa  497  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0805773  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0416  thermosome  48.96 
 
 		 548 aa  495  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213711 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1710  thermosome  47.89 
 
 		 562 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2699  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.67 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3171  thermosome subunit  47 
 
 		 547 aa  485  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000559701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.12 
 
 		 532 aa  488  1e-136  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.674517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0972  chaperonin Cpn60/TCP-1  48.94 
 
 		 537 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.862112  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2121  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.01 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0771  hypothetical protein  46.08 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0291157  hitchhiker  0.000000204198 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2113  chaperonin Cpn60/TCP-1  46.21 
 
 		 546 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0864  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.63 
 
 		 519 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2827  chaperonin Cpn60/TCP-1  45.63 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.27751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2902  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.57 
 
 		 525 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.174384  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0790  thermosome  42.75 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3203  chaperonin Cpn60/TCP-1  44.02 
 
 		 528 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.203796 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03134  T-complex protein 1 (Broad)  39.43 
 
 		 538 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_88066  predicted protein  37.84 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0363344 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01290  t-complex protein 1, delta subunit (tcp-1-delta), putative  40.35 
 
 		 535 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.692548  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21789  predicted protein  37.98 
 
 		 559 aa  375  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207672  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01960  conserved hypothetical protein  37.55 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87451  predicted protein  39.8 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.452422  decreased coverage  0.00282742 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_25908  predicted protein  39.69 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19811  predicted protein  39.69 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21430  predicted protein  39.02 
 
 		 541 aa  363  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25463  predicted protein  38.21 
 
 		 570 aa  362  8e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_66007  T-complex protein 1, epsilon subunit  38.37 
 
 		 550 aa  361  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34049  predicted protein  37.76 
 
 		 542 aa  353  5e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.013996  normal  0.104894 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01904  t-complex protein 1, epsilon subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07540)  37.64 
 
 		 548 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.512875  normal  0.991941 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26980  predicted protein  39.12 
 
 		 551 aa  350  6e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.24942  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66456  T-complex protein 1, delta subunit (TCP-1-delta) (CCT-delta)  39.29 
 
 		 533 aa  347  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85255  predicted protein  37.26 
 
 		 542 aa  346  7e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02700  t-complex protein 1, eta subunit (tcp-1-eta), putative  35.81 
 
 		 560 aa  342  8e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0993409  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05713  t-complex protein 1, eta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06710)  36.83 
 
 		 563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.7959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00480  T-complex protein 1 epsilon subunit, putative  37.88 
 
 		 548 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49043  predicted protein  37.98 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0141345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81386  predicted protein  35.67 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30446  predicted protein  36.99 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02918  t-complex protein 1, delta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07830)  36.13 
 
 		 536 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.116367 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37131  predicted protein  36.16 
 
 		 577 aa  333  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00830  t-complex protein 1, alpha subunit (tcp-1-alpha), putative  35.86 
 
 		 558 aa  326  7e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02149  t-complex protein 1, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16020)  33.21 
 
 		 568 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42602  predicted protein  35.06 
 
 		 530 aa  316  8e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.316899 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00381  t-complex protein 1, beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01740)  33.08 
 
 		 531 aa  280  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.469207  normal  0.320206 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04280  t-complex protein 1, beta subunit (tcp-1-beta), putative  31.77 
 
 		 523 aa  272  9e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.697024  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02460  t-complex protein 1, zeta subunit (tcp-1-zeta), putative  32.66 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830505  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49114  predicted protein  32.82 
 
 		 527 aa  270  2.9999999999999997e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.024249  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74533  cytoplasmic chaperonin of the Cct ring complex  33.27 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.265552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22666  predicted protein  32.71 
 
 		 546 aa  267  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34150  predicted protein  29.39 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00879554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2284  chaperonin Cpn60/TCP-1  32.94 
 
 		 564 aa  263  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.458197  normal  0.134197 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29714  predicted protein  33.01 
 
 		 534 aa  256  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191135  hitchhiker  0.0018905 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19801  predicted protein  33.01 
 
 		 534 aa  256  7e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.289192  normal  0.0151262 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89309  predicted protein  33.27 
 
 		 526 aa  256  8e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.140079  normal  0.133549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>