More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0933 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  100 
 
 
958 aa  1885    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.58 
 
 
1343 aa  242  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.43 
 
 
1438 aa  231  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.42 
 
 
510 aa  226  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.25 
 
 
1412 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  38.78 
 
 
1094 aa  221  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.62 
 
 
959 aa  204  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.16 
 
 
1224 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  32.76 
 
 
517 aa  190  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.3 
 
 
644 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.22 
 
 
1148 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  34.42 
 
 
501 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 
1139 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.08 
 
 
490 aa  164  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.56 
 
 
395 aa  164  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.36 
 
 
493 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.17 
 
 
546 aa  151  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.2 
 
 
1181 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
390 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.43 
 
 
524 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.8 
 
 
666 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.89 
 
 
670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.31 
 
 
399 aa  129  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.08 
 
 
323 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.48 
 
 
192 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  29.12 
 
 
1328 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.48 
 
 
667 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  25.06 
 
 
886 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.18 
 
 
313 aa  109  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.18 
 
 
302 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  35.15 
 
 
431 aa  105  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.16 
 
 
642 aa  104  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.31 
 
 
319 aa  101  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  31.31 
 
 
319 aa  100  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  27.12 
 
 
646 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.03 
 
 
370 aa  98.6  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.76 
 
 
176 aa  97.8  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.15 
 
 
646 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  28.84 
 
 
320 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.74 
 
 
1133 aa  95.9  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.75 
 
 
180 aa  95.5  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.64 
 
 
251 aa  94.7  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  27.56 
 
 
1194 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.76 
 
 
642 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.07 
 
 
1041 aa  92.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  30.09 
 
 
321 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  31.56 
 
 
323 aa  91.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.21 
 
 
408 aa  91.3  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.9 
 
 
325 aa  90.9  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.67 
 
 
320 aa  89.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
831 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.95 
 
 
838 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.49 
 
 
208 aa  89.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  32.11 
 
 
261 aa  89.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.05 
 
 
408 aa  89  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.22 
 
 
200 aa  89  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.38 
 
 
321 aa  89  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  31.86 
 
 
321 aa  88.6  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  24.87 
 
 
1475 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.57 
 
 
157 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.15 
 
 
320 aa  87  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.2 
 
 
223 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.07 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  29.05 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.58 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 
212 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.21 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.3 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.21 
 
 
220 aa  84.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
593 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.9 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1566  HEAT domain containing protein  23.91 
 
 
2243 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.832677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.8 
 
 
232 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  25.86 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2420  phosphorylase  31.3 
 
 
832 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562102  normal  0.19796 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.18 
 
 
178 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  29.28 
 
 
325 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.45 
 
 
334 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  33.51 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.6 
 
 
199 aa  79.7  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.31 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
492 aa  79  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.69 
 
 
321 aa  79  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.69 
 
 
773 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.45 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  29.45 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.26 
 
 
668 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.58 
 
 
824 aa  76.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.85 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  29.31 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.76 
 
 
221 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  28.68 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  26.1 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.97 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  35.97 
 
 
321 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.1 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.9 
 
 
173 aa  73.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.79 
 
 
464 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.76 
 
 
214 aa  72.8  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.12 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>