More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1701 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 148 aa  295  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.14 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.68 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  55.56 
 
 		 142 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  50.7 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  50.7 
 
 		 146 aa  146  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36660  TolR protein  52.74 
 
 		 150 aa  143  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0583237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  53.28 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  45.27 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4198  protein TolR  48.63 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.843588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3995  protein TolR  48.63 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2192  biopolymer transport TolR  56.72 
 
 		 142 aa  137  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164726  normal  0.458286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.79 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4404  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.95 
 
 		 153 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0822226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.01 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1220  biopolymer transport protein TolR  47.95 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1249  biopolymer transport, TolR  47.95 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.95 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  47.26 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.26 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.55 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  46.76 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  45.32 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.32 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  45.32 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  47.86 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  45.32 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  49.63 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  51.13 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  46.1 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  52.55 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  52.55 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.32 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1729  tolR protein  49.64 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.06 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.15 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  46.67 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  46.67 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  46.62 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  46.04 
 
 		 144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.04 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.37 
 
 		 145 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  43.15 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  45.8 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  41.61 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  46.46 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  46.46 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  43.07 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  43.18 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  45.67 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  46.62 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  46.62 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.68 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  44.53 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  38.35 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  38.06 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  45.32 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  42.64 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  41.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.78 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  41.67 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.62 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  45.86 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  39.39 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.46 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.86 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1135  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.54 
 
 		 152 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  39.84 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  40.15 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  40.77 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.86 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1431  tolR membrane protein  43.48 
 
 		 146 aa  97.1  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.87088e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  43.8 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  40.4 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  40.3 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003915  Tol biopolymer transport system TolR protein  44.2 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0762164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.86 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01608  hypothetical protein  43.48 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  39.39 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 162 aa  94.4  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.41 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>