More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0017 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
332 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  50.75 
 
 
354 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  52.19 
 
 
357 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  48.97 
 
 
355 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  52.5 
 
 
382 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  48.89 
 
 
365 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  50.94 
 
 
358 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  47.99 
 
 
355 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  47.99 
 
 
355 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  47.99 
 
 
355 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  47.99 
 
 
355 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  47.99 
 
 
355 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  47.99 
 
 
355 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  49.27 
 
 
352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  48.12 
 
 
355 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  49.27 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  46.89 
 
 
351 aa  284  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  49.27 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  49.27 
 
 
355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  49.27 
 
 
355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  49.84 
 
 
346 aa  282  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  49.69 
 
 
357 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  48.82 
 
 
355 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  47.9 
 
 
357 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  48.8 
 
 
356 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  50.5 
 
 
343 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  46.85 
 
 
356 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  48.46 
 
 
355 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  47.15 
 
 
359 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  48 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  48.75 
 
 
357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  47.49 
 
 
350 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  48.19 
 
 
358 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  49.17 
 
 
331 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  48.8 
 
 
356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  46.18 
 
 
357 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  47.8 
 
 
328 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  45.63 
 
 
467 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  46.65 
 
 
341 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  47.83 
 
 
358 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  49.37 
 
 
357 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  47.88 
 
 
363 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  45.29 
 
 
357 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  45.29 
 
 
357 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  43.98 
 
 
357 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  48.16 
 
 
339 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  45.29 
 
 
357 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  47.54 
 
 
355 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  47.13 
 
 
356 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  46.15 
 
 
341 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  47.16 
 
 
343 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  49.39 
 
 
356 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  49.39 
 
 
356 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  47.16 
 
 
343 aa  256  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  45.45 
 
 
355 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  46.08 
 
 
334 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  47.54 
 
 
391 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  45.61 
 
 
356 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  48.85 
 
 
332 aa  255  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  48.14 
 
 
356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  43.42 
 
 
357 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  45.19 
 
 
356 aa  249  7e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  46.58 
 
 
389 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  41.52 
 
 
350 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  45.49 
 
 
321 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 
429 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  42.73 
 
 
437 aa  228  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  45.06 
 
 
321 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  46.92 
 
 
331 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  48.29 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  44.74 
 
 
355 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  46.58 
 
 
331 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  47.96 
 
 
319 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  47.96 
 
 
319 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  47.96 
 
 
319 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  41.35 
 
 
332 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  58.39 
 
 
161 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  41.02 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  34.6 
 
 
321 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  30.79 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 
329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  30.4 
 
 
329 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  32.32 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.48 
 
 
328 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.48 
 
 
328 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  32.01 
 
 
320 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  27.18 
 
 
425 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  31.71 
 
 
328 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  31.53 
 
 
335 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  27.64 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  32.09 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  25.62 
 
 
371 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0807  secretion protein HlyD family protein  32.12 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  32.2 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  27.56 
 
 
395 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  25.84 
 
 
368 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  29.44 
 
 
281 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  33.44 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  30.91 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  30.38 
 
 
330 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>