100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0305 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  41.63 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  36.49 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  33.16 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  27.98 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  27.98 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  27.92 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  30.93 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  28.41 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  32.1 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.47 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  29.74 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  28.17 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  28.17 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  28.17 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.21 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  27.98 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.11 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  31.37 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.73 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.61 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  26.56 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.93 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  27.49 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.5 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.77 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  26.09 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  27.08 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  25.22 
 
 		 279 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.56 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  25.56 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  25.56 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  29.59 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  30.08 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  24.65 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.72 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.17 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  25.11 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  25.11 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  25.11 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  25.11 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  25.71 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  24.38 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  24.38 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  24.38 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.21 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.17 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  27.06 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  22.29 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  25.47 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.66 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.66 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  25.15 
 
 		 252 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  26.76 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  23.79 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.72 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  32.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  25.24 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.37 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.37 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  29.37 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  30.22 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  24.86 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  29.37 
 
 		 232 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  29.41 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  29.6 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  25 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  28.99 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2062  hypothetical protein  33.9 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0315  fimbrial chaperone  33.9 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.120821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1653  P pilus assembly protein, chaperone PapD  33.9 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1898  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.9 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1911  fimbrial chaperone yfcS precursor  33.9 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.595232  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0845  MrpD  33.9 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.788087  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  26.7 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.4 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.57 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  26.39 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  24.3 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  25.73 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  26.43 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  22.83 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.08 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  26.18 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  31.62 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4580  chaperone protein ClpE  29.57 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.393478 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  31.62 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  27.75 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  26.42 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 263 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 248 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  30.77 
 
 		 248 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  24.55 
 
 		 241 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>