19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0612 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  31.27 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  33.98 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  32.97 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  31.25 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  30.29 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  31.99 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  32.05 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  33.47 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  27.8 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  24.82 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  22.57 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  24.79 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  23.2 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  29.59 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3061  hypothetical protein  26.73 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06481  hypothetical protein  24.74 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  29.5 
 
 		 254 aa  42.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>