70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0343 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  100 
 
 		 241 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.44 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  31.4 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.91 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.5 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  31.63 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  31.63 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  28.18 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.63 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  28.71 
 
 		 244 aa  88.2  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  28.45 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  27.93 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  27.62 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.93 
 
 		 258 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  26.94 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  26.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.68 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.34 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  24.29 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.5 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.5 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  26.78 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.48 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  23.33 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.57 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  27.03 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  27.2 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.16 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  25.85 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.09 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  26.67 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  26.67 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  26.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  26.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  26.67 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  26.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.67 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  28.57 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  22.33 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  28.57 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  29.7 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  23.76 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  25.54 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  30.06 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  27.34 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  27.34 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  27.34 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.97 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  30.97 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  24.51 
 
 		 252 aa  52.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  21.8 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  23.63 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  25 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  29.03 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  27 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  26.37 
 
 		 282 aa  46.2  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  22.63 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  25.84 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  27.18 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  28.02 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1074  hypothetical protein  29.07 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  28.02 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  27.43 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>