68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2058 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  100 
 
 		 263 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.11 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.25 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  29.72 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.26 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.6 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.58 
 
 		 250 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  28.65 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  29.47 
 
 		 235 aa  85.5  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  28.25 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  26.09 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  26.09 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  26.09 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  27.98 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  28.24 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.5 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  29.91 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.35 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.23 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  28.66 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.67 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  26.61 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.19 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.18 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  27.43 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  29.39 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  29.39 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  29.39 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  29.39 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.44 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  23.71 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  27.08 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.1 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  28.98 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  28.98 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.98 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  25 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.53 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.02 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  25.48 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.73 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  28.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.26 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  26.26 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  26.54 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1096  hypothetical protein  24.54 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000563726  normal  0.588857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  26.54 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  23.2 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  25.37 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  25.37 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1497  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.307026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  25.37 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  25.37 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  25.19 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  24.63 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  28.09 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  25.78 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  23.28 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  28.16 
 
 		 249 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  23.73 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>