82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4396 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  100 
 
 
239 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  58.85 
 
 
243 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  53.39 
 
 
236 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  54.35 
 
 
236 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  52.97 
 
 
236 aa  217  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  51.66 
 
 
237 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  50.42 
 
 
237 aa  204  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  50.71 
 
 
236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  40.37 
 
 
238 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  47.34 
 
 
241 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  39.66 
 
 
242 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  40.38 
 
 
235 aa  144  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  41.71 
 
 
254 aa  141  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  36.32 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.94 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  39.39 
 
 
247 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  39.39 
 
 
247 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  34.75 
 
 
262 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  35.19 
 
 
262 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  34.51 
 
 
258 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  32.91 
 
 
260 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  31.49 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.77 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.95 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  38.1 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  35.81 
 
 
279 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  35.81 
 
 
279 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  35.81 
 
 
279 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.78 
 
 
258 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.38 
 
 
260 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  32.4 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  34.55 
 
 
288 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  35.37 
 
 
279 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  35.37 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  35.37 
 
 
279 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  35.37 
 
 
279 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  31.7 
 
 
250 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  31.7 
 
 
250 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  31.7 
 
 
250 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  26.97 
 
 
252 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  33.19 
 
 
279 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
241 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  36.7 
 
 
253 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  31.84 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  31.25 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.7 
 
 
262 aa  92.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  30.49 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  27.48 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  28.5 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.75 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.64 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.02 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  29.91 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  31.55 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  26.24 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  21.43 
 
 
227 aa  58.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  25.81 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  26.29 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  27.14 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  25.97 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  25.69 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.58 
 
 
248 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  24.79 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  29.61 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  26.17 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  24.58 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.36 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  28.95 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4477  pili assembly chaperone  27.61 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287547  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  24.87 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  22.12 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.63 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  26.6 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  26.6 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  26.6 
 
 
227 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  27.03 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>