19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03366 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3337  hypothetical protein  30.45 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0881978  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  21.43 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0765  hypothetical protein  25.12 
 
 
250 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  26.67 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  21.67 
 
 
235 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  23.13 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  24.62 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  22.81 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  23.39 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  19.8 
 
 
236 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  19.8 
 
 
237 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  21.03 
 
 
238 aa  42  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  23.72 
 
 
259 aa  41.6  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>