52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01133 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  36.64 
 
 
235 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.5 
 
 
242 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  37.5 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.62 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  34.05 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  35.16 
 
 
241 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  32.08 
 
 
238 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  33.81 
 
 
236 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  33.5 
 
 
236 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  33.5 
 
 
236 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.18 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.84 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.43 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.47 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  28.97 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.59 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  30.11 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  23.79 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  27.49 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  27.47 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  23.21 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  22.03 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  30 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  26.94 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  28.83 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  26.88 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.34 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  26.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  28.19 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  28.19 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  28.19 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  28.19 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  28.19 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  28.19 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  28.19 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.81 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  25.21 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  25.1 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  25.1 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  25.1 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  23.53 
 
 
288 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  23.53 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  23.53 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  27.27 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  23.32 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  22.8 
 
 
243 aa  45.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>