More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6522 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  77.36 
 
 		 567 aa  819    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  88.61 
 
 		 566 aa  943    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  59.89 
 
 		 565 aa  644    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  77.17 
 
 		 567 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  60.07 
 
 		 565 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  58.53 
 
 		 548 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  65.35 
 
 		 559 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  71.74 
 
 		 559 aa  790    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  59.5 
 
 		 572 aa  646    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  57.17 
 
 		 558 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  56.93 
 
 		 550 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  71.22 
 
 		 559 aa  760    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  59.17 
 
 		 557 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  59.71 
 
 		 549 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  61.01 
 
 		 556 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 561 aa  1121    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  60.9 
 
 		 564 aa  659    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  65.15 
 
 		 558 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  56.25 
 
 		 552 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  55.88 
 
 		 555 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.71 
 
 		 567 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  54.71 
 
 		 567 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  55.22 
 
 		 567 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  52.64 
 
 		 566 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  52.72 
 
 		 564 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  55.58 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  52.91 
 
 		 574 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  54 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  53.64 
 
 		 567 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  51.81 
 
 		 561 aa  555  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  53.46 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  53.65 
 
 		 552 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  52.18 
 
 		 572 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  52.33 
 
 		 575 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  51.61 
 
 		 575 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  52.78 
 
 		 581 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  50.83 
 
 		 556 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  52.47 
 
 		 552 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  53.75 
 
 		 559 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  54.14 
 
 		 582 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.85 
 
 		 572 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  53.22 
 
 		 553 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  51.7 
 
 		 564 aa  525  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.84 
 
 		 570 aa  525  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  48.84 
 
 		 570 aa  524  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  50.45 
 
 		 568 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  50.18 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 580 aa  508  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.82 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  48.47 
 
 		 576 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.94 
 
 		 572 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  48.99 
 
 		 558 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  45.26 
 
 		 567 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  44.39 
 
 		 568 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  38.53 
 
 		 552 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.36 
 
 		 551 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  41.56 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.67 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.96 
 
 		 565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.49 
 
 		 543 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.56 
 
 		 561 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.85 
 
 		 560 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.45 
 
 		 543 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  37.48 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  36.4 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.15 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.38 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.48 
 
 		 574 aa  253  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.4 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.71 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.97 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.97 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.97 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.97 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.78 
 
 		 548 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.78 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.21 
 
 		 548 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.43 
 
 		 572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 		 553 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.49 
 
 		 562 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.49 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.72 
 
 		 612 aa  244  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.04 
 
 		 564 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.48 
 
 		 554 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.91 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.03 
 
 		 572 aa  241  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.78 
 
 		 618 aa  240  5e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.62 
 
 		 602 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.78 
 
 		 567 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>