More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5523 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5523  ABC transporter related  100 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0407401  normal  0.45159 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8009  ABC transporter related  89.23 
 
 		 260 aa  477  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0114  ABC transporter related  78.33 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3307  ABC transporter related  73.02 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1048  ABC transporter related protein  68.88 
 
 		 249 aa  345  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2431  polar amino acid ABC transporter ATPase  60.33 
 
 		 256 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  60.17 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  58.92 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21470  amino acid ABC transporter, ATP binding component  61.98 
 
 		 269 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  61.25 
 
 		 243 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.85 
 
 		 242 aa  293  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1133  polar amino acid ABC transporter ATPase  62.92 
 
 		 278 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.772292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  59.17 
 
 		 243 aa  291  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  60.91 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.92 
 
 		 240 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.83 
 
 		 261 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.5 
 
 		 240 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1438  ABC transporter related  59.17 
 
 		 243 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  59.41 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  56.25 
 
 		 242 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  56.49 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  56.67 
 
 		 246 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  55.83 
 
 		 240 aa  285  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  59.58 
 
 		 243 aa  285  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4861  ABC transporter related  61.6 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.25 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  55.42 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0234  ABC transporter related  59 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  58.09 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  58.51 
 
 		 263 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  56.92 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  56.18 
 
 		 252 aa  281  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  57.08 
 
 		 244 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 269 aa  279  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  55 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  59.34 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  56.25 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.63 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  56.43 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3745  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.65 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  56.02 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3476  ABC transporter related  55.65 
 
 		 266 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  56.85 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  57.74 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1886  ABC transporter related  59.13 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  54.29 
 
 		 246 aa  277  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.34 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  58.51 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7665  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.15 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  55.6 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.43 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1028  ABC transporter related  59.66 
 
 		 240 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  55.6 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  57.92 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1133  ABC transporter related  54.81 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.010872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  57.61 
 
 		 246 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  57.74 
 
 		 269 aa  275  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  53.85 
 
 		 258 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  57.03 
 
 		 259 aa  275  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2007  ABC transporter related  58.94 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.069076  normal  0.0108344 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  57.44 
 
 		 247 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.83 
 
 		 249 aa  274  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.42 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  54.58 
 
 		 240 aa  274  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  55.78 
 
 		 267 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  57.08 
 
 		 253 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.42 
 
 		 249 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  54.65 
 
 		 257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  57.5 
 
 		 254 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  55.6 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.55 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.5 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  55.02 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.61 
 
 		 259 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  58.09 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.17 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.75 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.26 
 
 		 241 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.58 
 
 		 273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>