178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0598 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  75.79 
 
 		 410 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  89.22 
 
 		 409 aa  738    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  100 
 
 		 409 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  86.03 
 
 		 409 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  79.17 
 
 		 410 aa  639    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  80.88 
 
 		 410 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  83.58 
 
 		 410 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  85.54 
 
 		 409 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  83.09 
 
 		 412 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  83.09 
 
 		 412 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  88.73 
 
 		 409 aa  744    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  78.29 
 
 		 410 aa  680    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  76.23 
 
 		 410 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  84.8 
 
 		 409 aa  700    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  82.11 
 
 		 410 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  88.97 
 
 		 409 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  86.52 
 
 		 409 aa  747    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  87.01 
 
 		 409 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  83.09 
 
 		 412 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  83.58 
 
 		 410 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  81.62 
 
 		 409 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  88.97 
 
 		 409 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  70.44 
 
 		 411 aa  618  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  69.42 
 
 		 406 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  67.32 
 
 		 408 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  71.28 
 
 		 408 aa  566  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  63.1 
 
 		 397 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  56.93 
 
 		 414 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  57.78 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  57 
 
 		 416 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  57.03 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  54.11 
 
 		 451 aa  458  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  56.3 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  55.29 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  55.8 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  55.67 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  55.67 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  55.67 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  55.83 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  53.5 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  53.85 
 
 		 426 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  54.3 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  52.54 
 
 		 420 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  47.09 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  58.79 
 
 		 206 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  37.53 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  34.81 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  35.43 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  30.89 
 
 		 318 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.2 
 
 		 322 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  29.38 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  29.27 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  28.61 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  28.61 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  28.61 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.8 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  30.11 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  27.12 
 
 		 314 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  32.9 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  25.27 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  25 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  30.72 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  25.56 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.96 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.71 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  25.85 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  25.74 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  28.57 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  27.62 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.01 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  27.76 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  28.57 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  33.91 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  28.48 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  29.66 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  29.15 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  29.97 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  28.74 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  27.78 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  30.1 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  25 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  27.78 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.35 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  29 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  32.72 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  29.03 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  27.25 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  29.03 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  28.15 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  28.15 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.19 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  32.33 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  31.13 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.22 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  31.8 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  28.71 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>