More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0251 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  82.24 
 
 		 236 aa  355  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  74.58 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  78.64 
 
 		 231 aa  343  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  70.94 
 
 		 234 aa  330  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  70.09 
 
 		 240 aa  318  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  69.82 
 
 		 241 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  68.24 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  68.4 
 
 		 239 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7359  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  69.83 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5939  cytochrome c oxidase subunit III  70.18 
 
 		 240 aa  298  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1567  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  72.05 
 
 		 234 aa  298  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  68.04 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  72.56 
 
 		 240 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  69.51 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3798  cytochrome c oxidase subunit III  70.61 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4875  cytochrome c oxidase subunit III  70.61 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal  0.156188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  65.57 
 
 		 225 aa  267  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0299  cytochrome c oxidase subunit III  44.54 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  45.58 
 
 		 224 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5675  cytochrome c oxidase subunit III  42.49 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.670128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2202  cytochrome c oxidase, subunit III  40.42 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00239455  normal  0.978852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3466  cytochrome c oxidase subunit III  41.74 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0380593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0440  cytochrome c oxidase subunit III  43.98 
 
 		 208 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0994287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  37.88 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  37.37 
 
 		 203 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 204 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  38.24 
 
 		 832 aa  112  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  38.34 
 
 		 209 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  40.51 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  40.51 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  32.48 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  34.42 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  39.87 
 
 		 295 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1292  cytochrome c oxidase, subunit III  32.41 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  35.35 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  35 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  31.34 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  35.9 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  32.14 
 
 		 209 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  41.55 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1742  cytochrome ubiquinol oxidase subunit III  34.07 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  34.18 
 
 		 199 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.98 
 
 		 208 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  34.57 
 
 		 221 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2864  cytochrome c oxidase subunit III  37.2 
 
 		 205 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0115873 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  41.3 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  33.33 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4370  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3658  cytochrome c oxidase subunit III  31.48 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  40.58 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  41.73 
 
 		 200 aa  94  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2286  cytochrome c oxidase, subunit III  32.62 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.554784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  30.48 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  34.95 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  36.18 
 
 		 199 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.63 
 
 		 199 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  34.57 
 
 		 202 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5791  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  33.16 
 
 		 226 aa  92.4  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0858154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1975  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.45 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  36.48 
 
 		 279 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  33.96 
 
 		 199 aa  91.7  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.99 
 
 		 819 aa  92  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  38.36 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  37.34 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  31.05 
 
 		 205 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.88 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  35.26 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  36.48 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.08 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  31.28 
 
 		 291 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33.17 
 
 		 825 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  32.31 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5610  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.55 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3100  cytochrome c oxidase subunit III  35.18 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2105  cytochrome c oxidase, subunit III  34.39 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  39.71 
 
 		 291 aa  89.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  36.48 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01165  probable cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  38.89 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0597  cytochrome c oxidase, subunit III  31.91 
 
 		 209 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.788928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6214  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.95 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0222  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 198 aa  89.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1733  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.14 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5987  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.02 
 
 		 208 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4059  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  30 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0979627  normal  0.293144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2332  cytochrome c oxidase, subunit III  39.86 
 
 		 271 aa  89  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.938653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  40.44 
 
 		 290 aa  89  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2088  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  35.45 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2069  cytochrome c oxidase, subunit III  35.45 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6008  cytochrome c oxidase, subunit III  35.45 
 
 		 202 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0674382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  37.96 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0352  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.02 
 
 		 204 aa  88.6  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  32.45 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1141  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit III  30.69 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>