More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1368 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
402 aa  805    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  54.04 
 
 
403 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  50.63 
 
 
398 aa  389  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  47.38 
 
 
411 aa  389  1e-107  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  49.36 
 
 
409 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  48.98 
 
 
397 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
397 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  46.65 
 
 
411 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  44.76 
 
 
406 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  47.38 
 
 
410 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  46.74 
 
 
397 aa  355  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  44.47 
 
 
408 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  44.23 
 
 
408 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 
408 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  44.23 
 
 
408 aa  350  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  44.23 
 
 
408 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  44.23 
 
 
408 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 
403 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  46.05 
 
 
403 aa  348  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
403 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 
403 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  44.12 
 
 
409 aa  345  8e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  43.48 
 
 
404 aa  340  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  46.74 
 
 
400 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  46.32 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  41.25 
 
 
410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  46.08 
 
 
404 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  46.08 
 
 
404 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  45.83 
 
 
404 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  45.83 
 
 
404 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  40.8 
 
 
404 aa  330  2e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  42.45 
 
 
407 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  42.71 
 
 
404 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  41.94 
 
 
404 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
404 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.72 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
399 aa  300  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  38.25 
 
 
431 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  38.15 
 
 
487 aa  289  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  39.6 
 
 
405 aa  286  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  37.18 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
413 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  38.6 
 
 
416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  36.59 
 
 
411 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  38.34 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  37.31 
 
 
416 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 
423 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  36.96 
 
 
418 aa  245  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  37.33 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  37.66 
 
 
420 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 
410 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  37.53 
 
 
389 aa  234  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 
395 aa  231  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  34.45 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  34.19 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
407 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  32.08 
 
 
412 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
406 aa  199  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
404 aa  193  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  31.12 
 
 
407 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  24.82 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  24.82 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  30.28 
 
 
450 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  27.23 
 
 
408 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.77 
 
 
391 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.27 
 
 
410 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.24 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.7 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
389 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  23.66 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.16 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
387 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  23.08 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.07 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  24.35 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
435 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.13 
 
 
1833 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
425 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  22.68 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  24.59 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  38.14 
 
 
393 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>