More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2293 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
513 aa  964  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  49.45 
 
 
485 aa  352  7e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  48.25 
 
 
481 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  47.77 
 
 
471 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  43 
 
 
489 aa  291  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  41.91 
 
 
500 aa  270  3e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 
487 aa  271  3e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.81 
 
 
763 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.55 
 
 
487 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  41.29 
 
 
486 aa  262  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
472 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.67 
 
 
508 aa  259  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 
494 aa  255  1e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1431  major facilitator superfamily MFS_1  48.06 
 
 
733 aa  253  9e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.634406  normal  0.254269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  46.62 
 
 
463 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.03 
 
 
490 aa  246  7e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.97 
 
 
527 aa  245  1e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.95 
 
 
487 aa  242  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.7 
 
 
478 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.21 
 
 
493 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.82 
 
 
498 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  38.55 
 
 
497 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.94 
 
 
489 aa  235  2e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.74 
 
 
490 aa  233  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.88 
 
 
474 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 
553 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  37.04 
 
 
498 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.51 
 
 
788 aa  223  5e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.52 
 
 
522 aa  223  5e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.49 
 
 
478 aa  222  1e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.49 
 
 
507 aa  221  2e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  34.62 
 
 
458 aa  220  4e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.34 
 
 
479 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 
478 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.08 
 
 
519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.77 
 
 
484 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 
528 aa  217  3e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
482 aa  217  3e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
506 aa  216  6e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  36.42 
 
 
470 aa  216  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.81 
 
 
534 aa  214  4e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.05 
 
 
478 aa  213  6e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  34.84 
 
 
481 aa  213  8e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 
505 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.18 
 
 
519 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  37.75 
 
 
463 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  2.85964e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  38.14 
 
 
470 aa  211  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  41.29 
 
 
507 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 
478 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.67 
 
 
492 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  37.28 
 
 
498 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 
483 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 
500 aa  206  8e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
503 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.35 
 
 
502 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
478 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 
457 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  37.02 
 
 
483 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.75 
 
 
452 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  38 
 
 
475 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 
491 aa  203  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 
514 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  38.24 
 
 
519 aa  202  1e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.32 
 
 
482 aa  202  1e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  202  1e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  201  2e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  201  2e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.54 
 
 
486 aa  201  2e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 
487 aa  201  4e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 
509 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.49 
 
 
469 aa  199  1e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.72 
 
 
479 aa  199  1e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  37.44 
 
 
489 aa  199  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.23 
 
 
478 aa  199  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.3 
 
 
479 aa  198  2e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  38.98 
 
 
499 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 
479 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.49 
 
 
479 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 
482 aa  197  5e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.14 
 
 
482 aa  197  5e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 
518 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.34 
 
 
501 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.3 
 
 
1112 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 
494 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.81 
 
 
524 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.74 
 
 
757 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.86 
 
 
508 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.86 
 
 
503 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.54 
 
 
458 aa  194  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.12 
 
 
504 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.06 
 
 
497 aa  193  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.7 
 
 
476 aa  193  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1772  major facilitator transporter  38.16 
 
 
487 aa  193  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.819492  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  39.45 
 
 
505 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.7 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.7 
 
 
468 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.13 
 
 
397 aa  191  3e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  35.23 
 
 
468 aa  191  3e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>