More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1671 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
620 aa  1182    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2455  diguanylate cyclase  42.72 
 
 
699 aa  224  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
793 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
767 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
520 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.49 
 
 
921 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
729 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
626 aa  150  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
770 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  34.34 
 
 
378 aa  147  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3436  histidine kinase  37.74 
 
 
362 aa  143  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  41.39 
 
 
692 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3731  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
411 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
681 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
1195 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
697 aa  140  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
951 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  37.59 
 
 
268 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
407 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
810 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  35.85 
 
 
564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
880 aa  137  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
535 aa  136  9e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
1669 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
642 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
792 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
786 aa  136  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
643 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
714 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
412 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1289  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
761 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
817 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
361 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
973 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
664 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
527 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
527 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
527 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  36.8 
 
 
528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
502 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
838 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  35.6 
 
 
874 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
529 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
450 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  35.4 
 
 
723 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  35.4 
 
 
723 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
543 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  35.4 
 
 
723 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  35.4 
 
 
723 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
575 aa  127  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  36.54 
 
 
552 aa  127  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3356  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
401 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1994  histidine kinase  33.95 
 
 
387 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376445  hitchhiker  0.00440814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
677 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
769 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  33.98 
 
 
494 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 
821 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 
821 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  35.05 
 
 
821 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  35.38 
 
 
421 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
960 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1080  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
1128 aa  125  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  33.12 
 
 
565 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
789 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
1140 aa  124  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
385 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
929 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
1267 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
680 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
412 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.111362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
640 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  33.85 
 
 
812 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  41.26 
 
 
584 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
730 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0059666  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
809 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  33.92 
 
 
762 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
1028 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
628 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
821 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
368 aa  120  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
521 aa  120  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
1532 aa  120  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
683 aa  120  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
515 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1670  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261958  normal  0.184327 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
713 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.908922  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
1064 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
710 aa  118  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>