More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0359 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
542 aa  1073    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  54.14 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.49 
 
 
546 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.41 
 
 
536 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  56.46 
 
 
562 aa  325  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.04 
 
 
623 aa  323  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
542 aa  312  9e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  52.23 
 
 
518 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.55 
 
 
545 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  59.67 
 
 
533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  44.44 
 
 
540 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
538 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  55.76 
 
 
531 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.1 
 
 
538 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 
394 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  49.53 
 
 
530 aa  290  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  45.6 
 
 
543 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
545 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 
535 aa  282  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  53.14 
 
 
538 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.56 
 
 
537 aa  280  6e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  50.6 
 
 
407 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  52.03 
 
 
540 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  57 
 
 
533 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.35 
 
 
538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.12 
 
 
528 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.68 
 
 
544 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.2 
 
 
538 aa  256  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  49.53 
 
 
540 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.19 
 
 
522 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.11 
 
 
544 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  46.39 
 
 
583 aa  247  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
535 aa  246  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.36 
 
 
535 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.32 
 
 
547 aa  240  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.28 
 
 
532 aa  237  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  46.69 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  51.43 
 
 
535 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
1150 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.55 
 
 
523 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.3 
 
 
904 aa  228  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.93 
 
 
702 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.22 
 
 
545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
531 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.26 
 
 
538 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 
715 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.41 
 
 
545 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.5 
 
 
858 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.35 
 
 
530 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
529 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.95 
 
 
550 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
539 aa  200  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
515 aa  200  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  35.68 
 
 
563 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  48.63 
 
 
965 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 
562 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 
397 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
524 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 
566 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.06 
 
 
566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 
561 aa  190  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
563 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.09 
 
 
689 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 
656 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 
561 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  37.98 
 
 
563 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.4 
 
 
697 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.15 
 
 
567 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.67 
 
 
572 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.16 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 
565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.15 
 
 
560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  38.17 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 
563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 
562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 
563 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 
563 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  37.81 
 
 
676 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.83 
 
 
691 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.56 
 
 
730 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 
667 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
657 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 
741 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.53 
 
 
449 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
712 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  36.75 
 
 
656 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  36.18 
 
 
733 aa  180  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.88 
 
 
656 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 
731 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  47.92 
 
 
533 aa  179  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39 
 
 
711 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 
561 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.5 
 
 
730 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 
669 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1802  chemotaxis sensory transducer  45.61 
 
 
438 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  34.49 
 
 
561 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.15 
 
 
493 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 
563 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>