100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0283 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  55.74 
 
 
257 aa  276  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  42.67 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  40.74 
 
 
268 aa  171  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  37.39 
 
 
266 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  38.46 
 
 
260 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  40.08 
 
 
270 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  34.5 
 
 
368 aa  145  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  33.91 
 
 
412 aa  135  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  42.08 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  33.33 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  34.53 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  35.06 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  35.06 
 
 
249 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  33.74 
 
 
556 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  33.19 
 
 
323 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  33.91 
 
 
316 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  38.6 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  31.88 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  32.61 
 
 
521 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  34.09 
 
 
234 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  39.5 
 
 
192 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  31.22 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  34.74 
 
 
218 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  27.11 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  30.93 
 
 
268 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  31.58 
 
 
353 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  26.94 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.57 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  34.13 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  34.13 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  42.22 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  31.34 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  32.81 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  27.87 
 
 
236 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.62 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  34.58 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  28.29 
 
 
286 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  30.82 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.84 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.37 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  25.37 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  25.37 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  27 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  38.89 
 
 
302 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  28.49 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1727  sortase family protein  45.07 
 
 
288 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  35.14 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.51 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  25.71 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.04 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  25 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  27.78 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  24.51 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  29.86 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.84 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.22 
 
 
206 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  32.37 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  24.27 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  31.51 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2899  peptidase C60, sortase A and B  29.55 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  27.08 
 
 
316 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1003  sortase family protein  42.65 
 
 
301 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  22.64 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  31.53 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32.09 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  30.88 
 
 
291 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2294  sortase family protein  32.41 
 
 
199 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  38.4 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  30 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  27.5 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  30.4 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2937  peptidase C60, sortase A and B  29.2 
 
 
195 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  24.09 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  23.36 
 
 
210 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  23.36 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  29.63 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.36 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  27.15 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.36 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.36 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  28.47 
 
 
308 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  23.36 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.82 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  28.47 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.82 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  22.94 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  32.69 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.65 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  31.25 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7660  peptidase C60 sortase A and B  29.66 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3923  sortase family protein  30.34 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  31.25 
 
 
267 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  32.9 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  31.82 
 
 
354 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  23.44 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  28.66 
 
 
207 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  33.67 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  24.85 
 
 
273 aa  42  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2276  sortase family protein  29.41 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0587007  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>